108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0217 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  100 
 
 		 1102 aa  2207    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  42.12 
 
 		 1327 aa  399  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  41.92 
 
 		 1327 aa  396  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  42.15 
 
 		 1349 aa  396  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  40.33 
 
 		 1579 aa  369  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  37.32 
 
 		 1594 aa  363  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  33.05 
 
 		 2637 aa  359  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  41.54 
 
 		 773 aa  345  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  35.04 
 
 		 4391 aa  339  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  35.16 
 
 		 1806 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  34.58 
 
 		 4312 aa  336  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  37.42 
 
 		 1327 aa  333  7.000000000000001e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.83 
 
 		 868 aa  326  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  37.42 
 
 		 466 aa  325  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  33.39 
 
 		 1165 aa  319  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  33.39 
 
 		 1165 aa  319  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  39.63 
 
 		 955 aa  263  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  39.63 
 
 		 955 aa  262  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  31.88 
 
 		 989 aa  260  8e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  42.86 
 
 		 338 aa  247  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  41.78 
 
 		 306 aa  240  9e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  28.7 
 
 		 2057 aa  218  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  31.36 
 
 		 1277 aa  209  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  29.64 
 
 		 1234 aa  201  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  34.44 
 
 		 1004 aa  201  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.2 
 
 		 806 aa  200  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  33.23 
 
 		 997 aa  190  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  32.64 
 
 		 1626 aa  175  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.34 
 
 		 1234 aa  162  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  25.34 
 
 		 1250 aa  162  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  25.34 
 
 		 1234 aa  162  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  25.19 
 
 		 1252 aa  160  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  25.19 
 
 		 1250 aa  159  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  25.56 
 
 		 1234 aa  158  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.65 
 
 		 1086 aa  154  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  28.96 
 
 		 3322 aa  149  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  27.06 
 
 		 1254 aa  144  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  25.44 
 
 		 1108 aa  132  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  26.21 
 
 		 995 aa  129  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  27.49 
 
 		 950 aa  125  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  23.09 
 
 		 1028 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  26.01 
 
 		 1113 aa  120  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  26.57 
 
 		 1861 aa  114  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  26.27 
 
 		 2578 aa  112  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  26.27 
 
 		 2906 aa  112  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  25.7 
 
 		 1571 aa  110  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  23.96 
 
 		 2926 aa  102  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  24.34 
 
 		 947 aa  102  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  27.36 
 
 		 1259 aa  102  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  28.53 
 
 		 861 aa  102  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  26.4 
 
 		 1259 aa  101  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  27.36 
 
 		 1268 aa  101  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  27.53 
 
 		 1285 aa  99  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.33 
 
 		 1055 aa  98.6  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  27.53 
 
 		 1269 aa  98.2  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  25.53 
 
 		 1254 aa  98.2  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  25.06 
 
 		 1012 aa  96.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  26.01 
 
 		 3420 aa  95.5  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  27.36 
 
 		 1040 aa  95.5  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.57 
 
 		 1357 aa  94.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  25.88 
 
 		 3415 aa  93.6  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  22.67 
 
 		 825 aa  88.2  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  25.27 
 
 		 1593 aa  87.8  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  25.17 
 
 		 1741 aa  87.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  22.72 
 
 		 819 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  32.7 
 
 		 2003 aa  85.9  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  25.91 
 
 		 1099 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.12 
 
 		 1023 aa  83.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  22.65 
 
 		 818 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  25.41 
 
 		 1093 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  25.41 
 
 		 1093 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  32.8 
 
 		 1770 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  32.91 
 
 		 1115 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  32.8 
 
 		 1763 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  33.55 
 
 		 1049 aa  67  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  32.26 
 
 		 1762 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  32.78 
 
 		 1770 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  32.26 
 
 		 1762 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  32.09 
 
 		 1753 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  40 
 
 		 909 aa  65.5  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  42.06 
 
 		 924 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  34.51 
 
 		 1748 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  29.94 
 
 		 914 aa  62  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  47.37 
 
 		 506 aa  62  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  47.37 
 
 		 506 aa  62  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  22.47 
 
 		 773 aa  61.6  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  33.08 
 
 		 927 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.71 
 
 		 1009 aa  58.5  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  32.12 
 
 		 864 aa  57.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  23.04 
 
 		 638 aa  56.6  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0823  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.81 
 
 		 855 aa  57  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.54 
 
 		 870 aa  55.1  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  22.58 
 
 		 638 aa  55.1  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  22.58 
 
 		 638 aa  55.1  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  24.06 
 
 		 815 aa  53.5  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  35 
 
 		 2642 aa  52.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  38.67 
 
 		 1180 aa  52.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.34 
 
 		 1532 aa  52.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  22.94 
 
 		 769 aa  51.6  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.46 
 
 		 1039 aa  51.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>