64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0314 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 258 aa  510  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  55.65 
 
 		 245 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  57.61 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  57.61 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  57.96 
 
 		 260 aa  230  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  58.33 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  53.23 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  55.6 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  54.78 
 
 		 254 aa  224  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  56.64 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  59.11 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  56.43 
 
 		 253 aa  222  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  52.05 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  57.21 
 
 		 245 aa  219  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  64 
 
 		 240 aa  218  7.999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  53.54 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  61.68 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  55.31 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  53.68 
 
 		 244 aa  211  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  45.85 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  64.85 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  57.85 
 
 		 256 aa  208  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  55.6 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  46.96 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  47.2 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  55.76 
 
 		 244 aa  197  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  46.69 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  56.41 
 
 		 252 aa  195  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  54.98 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  53.5 
 
 		 253 aa  191  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  56.44 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  49.58 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  52.21 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  44.31 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  42.23 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  45.06 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  47.6 
 
 		 242 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  48.99 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  47.27 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  42.4 
 
 		 247 aa  178  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  44.12 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  42.21 
 
 		 247 aa  175  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  55.14 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  44.7 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  45.41 
 
 		 242 aa  172  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  42.04 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  43.78 
 
 		 245 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  45.57 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  45.57 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  42.86 
 
 		 245 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  43.52 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  45.11 
 
 		 241 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  44.26 
 
 		 241 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  39.92 
 
 		 242 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.55 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  35.92 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  34.72 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  33.05 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25.82 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  27.91 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  24.88 
 
 		 269 aa  48.9  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.04 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  25.71 
 
 		 266 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2845  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.92 
 
 		 251 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13713  normal  0.308482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>