More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1514 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  39.72 
 
 		 1164 aa  684    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  37.95 
 
 		 1167 aa  670    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  50.93 
 
 		 1145 aa  1004    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  40.93 
 
 		 1162 aa  741    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  42.04 
 
 		 1162 aa  761    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  37.53 
 
 		 1164 aa  667    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  37.28 
 
 		 1164 aa  660    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  41.25 
 
 		 1162 aa  736    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  38.05 
 
 		 1167 aa  670    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  48.86 
 
 		 1138 aa  980    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  50.21 
 
 		 1138 aa  983    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  42.79 
 
 		 1163 aa  739    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  40.88 
 
 		 1168 aa  706    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  49.41 
 
 		 1138 aa  979    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  40 
 
 		 1168 aa  729    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  39.23 
 
 		 1167 aa  682    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  48.2 
 
 		 1138 aa  920    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  42.23 
 
 		 1162 aa  754    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  40.95 
 
 		 1164 aa  724    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  39.85 
 
 		 1167 aa  672    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  50.6 
 
 		 1133 aa  998    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  49.16 
 
 		 1138 aa  978    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  42.52 
 
 		 1164 aa  765    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  49.19 
 
 		 1140 aa  941    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  51.23 
 
 		 1142 aa  1010    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  50.89 
 
 		 1142 aa  1012    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  49.41 
 
 		 1144 aa  959    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  51.65 
 
 		 1141 aa  1013    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  42.64 
 
 		 1162 aa  761    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  50.98 
 
 		 1142 aa  1011    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  49.91 
 
 		 1145 aa  1001    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  100 
 
 		 1139 aa  2300    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  37.63 
 
 		 1165 aa  635  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  37.13 
 
 		 1171 aa  615  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  35.83 
 
 		 1198 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  35.47 
 
 		 1171 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  36.31 
 
 		 1175 aa  594  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  36.23 
 
 		 1170 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  36.15 
 
 		 1268 aa  589  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  36.31 
 
 		 1170 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  36.23 
 
 		 1170 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  35.74 
 
 		 1170 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  36.15 
 
 		 1202 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  36.15 
 
 		 1200 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  36.23 
 
 		 1170 aa  586  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  35.77 
 
 		 1170 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  35.59 
 
 		 1170 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  35.59 
 
 		 1170 aa  582  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  36.3 
 
 		 1182 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  35.5 
 
 		 1170 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  36.41 
 
 		 1175 aa  572  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  36.21 
 
 		 1171 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  35 
 
 		 1168 aa  558  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  46.41 
 
 		 814 aa  555  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  34.86 
 
 		 1152 aa  549  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  35.05 
 
 		 1142 aa  545  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  35.24 
 
 		 1167 aa  504  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.94 
 
 		 1176 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1735  chromosome segregation protein SMC  73.49 
 
 		 299 aa  446  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  29.64 
 
 		 1189 aa  425  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  29.51 
 
 		 1189 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  29.03 
 
 		 1189 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  29.63 
 
 		 1189 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  29.03 
 
 		 1189 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  29.03 
 
 		 1189 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  29.51 
 
 		 1189 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  41.86 
 
 		 1162 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  44.15 
 
 		 1195 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  42.92 
 
 		 1162 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  61.24 
 
 		 1170 aa  405  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  41.7 
 
 		 1162 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  41.69 
 
 		 1162 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  41.58 
 
 		 1162 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  28.01 
 
 		 1185 aa  384  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  55.56 
 
 		 1162 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  55.5 
 
 		 1168 aa  381  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  31.01 
 
 		 1403 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  46.89 
 
 		 1169 aa  372  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  45.69 
 
 		 1169 aa  343  2e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  71.86 
 
 		 1165 aa  342  2.9999999999999998e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  39.05 
 
 		 1171 aa  336  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  37.36 
 
 		 1172 aa  334  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  50.45 
 
 		 1170 aa  333  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  53.35 
 
 		 1171 aa  333  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  49.44 
 
 		 1198 aa  332  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  50.9 
 
 		 1234 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  51.6 
 
 		 1206 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  45.8 
 
 		 1170 aa  323  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  44.67 
 
 		 1174 aa  320  7e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  44.67 
 
 		 1174 aa  320  7e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  52.1 
 
 		 1109 aa  314  4.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  49.36 
 
 		 1173 aa  308  5.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  58.58 
 
 		 1181 aa  304  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  61.93 
 
 		 1204 aa  303  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  57.14 
 
 		 1171 aa  302  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  35.66 
 
 		 1175 aa  299  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  62.67 
 
 		 1190 aa  298  4e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  60.75 
 
 		 1167 aa  294  8e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  39.18 
 
 		 1307 aa  287  5.999999999999999e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0467  SMC domain-containing protein  56.19 
 
 		 1280 aa  284  6.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>