245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3865 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3979  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 189 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3865  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 189 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.282134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4198  isochorismatase hydrolase  78.84 
 
 		 189 aa  321  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  78.26 
 
 		 217 aa  316  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  78.26 
 
 		 217 aa  316  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  78.26 
 
 		 217 aa  316  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5005  putative isochorismatase hydrolase  79.67 
 
 		 189 aa  315  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0745  isochorismatase hydrolase  79.35 
 
 		 211 aa  315  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955139 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4618  isochorismatase hydrolase  82.18 
 
 		 218 aa  312  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  77.3 
 
 		 243 aa  309  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0364  putative isochorismate hydrolase  77.01 
 
 		 223 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  76.5 
 
 		 211 aa  296  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  75.29 
 
 		 212 aa  290  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  75.41 
 
 		 211 aa  290  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  39.66 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  39.27 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  36.98 
 
 		 197 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  36.17 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  37.02 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4146  isochorismatase hydrolase  39.33 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0661023  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  36.18 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0155  hypothetical protein  55.84 
 
 		 135 aa  92  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586581  normal  0.969052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 174 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  31.76 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  30.64 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  26.95 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  28.03 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  26.77 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  26.24 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  26.7 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 187 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 187 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 187 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  26.37 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  26.37 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  26.37 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  26.37 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  26.37 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  29.27 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  26.29 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  26.29 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  26.29 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  25.81 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  26.29 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  26.29 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  26.29 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  29.88 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 214 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  28.4 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  26.8 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  25.62 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  24.87 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  24.87 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  30.72 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  26.62 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  29.69 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  27.55 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  26.62 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  27.78 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  26.78 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  27.03 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  26.26 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  26.62 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  28.31 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  26.95 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  24.64 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  28.19 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  28.83 
 
 		 231 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  27.12 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  28 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  24.74 
 
 		 533 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  25.7 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  26.04 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  27.1 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  28 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  27.16 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  28.87 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  26.49 
 
 		 239 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  25.4 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 225 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  28.47 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  30.19 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  27.78 
 
 		 207 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  27.78 
 
 		 207 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  26.06 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>