65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0958 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
212 aa  426  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  58.9 
 
 
231 aa  246  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  41.03 
 
 
1444 aa  131  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  36.98 
 
 
1505 aa  117  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  32.06 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  29.6 
 
 
1194 aa  97.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  27.23 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  28.5 
 
 
451 aa  80.5  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  31.63 
 
 
453 aa  77  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  30.5 
 
 
451 aa  76.3  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  30.14 
 
 
501 aa  75.5  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  27.16 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  28.7 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  28.02 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  29.65 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  29.86 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  31.94 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  29.05 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  26.94 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  27.7 
 
 
193 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  27.16 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  28.08 
 
 
1140 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  27.75 
 
 
515 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  29.59 
 
 
322 aa  63.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  26.54 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  28.91 
 
 
321 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  28.45 
 
 
234 aa  59.3  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0813  protein of unknown function DUF1080  26.57 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  26.09 
 
 
260 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  26.11 
 
 
240 aa  57.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  29.07 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2104  hypothetical protein  25.54 
 
 
894 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.788762  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  23.98 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  26.67 
 
 
237 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  25.23 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2243  protein of unknown function DUF1080  27.18 
 
 
884 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  24.87 
 
 
1145 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  28.78 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  25.5 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  29.63 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  31.92 
 
 
255 aa  51.6  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  26.49 
 
 
424 aa  51.6  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  28.49 
 
 
455 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  24.3 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  24.14 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  25.87 
 
 
198 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  28.67 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  27.44 
 
 
255 aa  48.5  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  22.64 
 
 
244 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  26.79 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  26.67 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  29.63 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2463  hypothetical protein  34.44 
 
 
257 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  23.74 
 
 
269 aa  46.2  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  27.83 
 
 
452 aa  46.2  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  29.45 
 
 
308 aa  45.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  26.63 
 
 
272 aa  45.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  26.86 
 
 
276 aa  45.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  26.32 
 
 
453 aa  45.1  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1383  hypothetical protein  25.74 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  24.68 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  25.35 
 
 
254 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  25.78 
 
 
259 aa  42  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3672  protein of unknown function DUF1080  26.79 
 
 
276 aa  42.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  24.36 
 
 
440 aa  42  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>