More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5185 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  100 
 
 		 221 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  90.95 
 
 		 221 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  76.82 
 
 		 221 aa  358  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  73.76 
 
 		 222 aa  350  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  73.76 
 
 		 222 aa  350  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  73.3 
 
 		 222 aa  346  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  48.65 
 
 		 223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  49.1 
 
 		 226 aa  209  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  48.2 
 
 		 221 aa  198  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  41.89 
 
 		 223 aa  194  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  46.4 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  40.99 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  35.45 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  39.45 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  39.82 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  37.5 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  39.37 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  37.61 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  40.72 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  41.28 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  38.36 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  42.25 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  39.19 
 
 		 229 aa  151  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  36.74 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  41.44 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  41.01 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  37.84 
 
 		 231 aa  148  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  40.37 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  38.22 
 
 		 224 aa  147  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  38.12 
 
 		 254 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  42.53 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  36.44 
 
 		 247 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  37.39 
 
 		 220 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  39.7 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  41.78 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  37.5 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  37.5 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  41.07 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  37.56 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  37.04 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  35.87 
 
 		 231 aa  138  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  34.08 
 
 		 225 aa  138  7.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  40.18 
 
 		 242 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  34.39 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  40.18 
 
 		 242 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  32.72 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  37 
 
 		 249 aa  135  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  36.73 
 
 		 236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  33.18 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  34.78 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  38.01 
 
 		 224 aa  132  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  34.26 
 
 		 240 aa  131  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  34.93 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  38.07 
 
 		 237 aa  128  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  35.45 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  34.83 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  34.08 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  34.52 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  31.31 
 
 		 226 aa  118  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  34.98 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  34.86 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  37.33 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  34.82 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  34.4 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  34.1 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  31.84 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  31.96 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  30.8 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  32.41 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  31.65 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  32.43 
 
 		 244 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  32.88 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  33.03 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  33.48 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  31.08 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  29.86 
 
 		 241 aa  91.7  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  31.46 
 
 		 270 aa  90.9  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  28.12 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  28.7 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  28.12 
 
 		 234 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  29.18 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  26.89 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  34.78 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  31.48 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  28.38 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  25.34 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  27.23 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  31.36 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  23.35 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  29.15 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.65 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.24 
 
 		 187 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  25.47 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  26.92 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  45.61 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.84 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  29.07 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  48 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  48 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  27.8 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>