195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2288 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
739 aa  1434    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  84.59 
 
 
742 aa  1104    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  57.69 
 
 
880 aa  478  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  46.6 
 
 
742 aa  445  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  41.27 
 
 
720 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  42.62 
 
 
673 aa  226  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  40.34 
 
 
663 aa  212  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  43.37 
 
 
651 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  44.44 
 
 
617 aa  210  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  43.06 
 
 
723 aa  205  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  43.42 
 
 
718 aa  204  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  42.7 
 
 
717 aa  203  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  40.86 
 
 
697 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0695  OmpA/MotB domain-containing protein  44.68 
 
 
624 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  41.87 
 
 
727 aa  187  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  42.55 
 
 
306 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5566  OmpA/MotB domain-containing protein  41.48 
 
 
348 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  37.41 
 
 
701 aa  168  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.67 
 
 
701 aa  167  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  37.28 
 
 
730 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  45.53 
 
 
1619 aa  79  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  39.52 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  39.64 
 
 
270 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  37.1 
 
 
229 aa  72  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  39.64 
 
 
270 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  35.9 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  36.94 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  39.64 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 
216 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  39.32 
 
 
212 aa  68.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  37.9 
 
 
229 aa  68.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  35.48 
 
 
229 aa  68.6  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  50 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  42.02 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  37.5 
 
 
271 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  38.39 
 
 
270 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  36.28 
 
 
216 aa  67  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 
288 aa  67  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  37.5 
 
 
320 aa  66.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  46.99 
 
 
223 aa  65.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  37.93 
 
 
212 aa  65.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 
454 aa  64.7  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 
333 aa  65.1  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  39.13 
 
 
575 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  43.68 
 
 
466 aa  64.3  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 
213 aa  64.3  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  44.83 
 
 
457 aa  64.3  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  36.04 
 
 
296 aa  64.3  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  35.71 
 
 
271 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  47.83 
 
 
222 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 
468 aa  63.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  36.04 
 
 
270 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  38.05 
 
 
727 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  40 
 
 
212 aa  63.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  36.04 
 
 
286 aa  63.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  43.59 
 
 
227 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 
374 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  41.67 
 
 
230 aa  62.4  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 
280 aa  62  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 
222 aa  62  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 
215 aa  61.6  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 
487 aa  61.2  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  44.58 
 
 
192 aa  61.2  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  40.91 
 
 
269 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 
333 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  39.22 
 
 
220 aa  60.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
367 aa  60.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  34.48 
 
 
217 aa  60.5  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  36.61 
 
 
269 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  39.45 
 
 
208 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 
466 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  44.93 
 
 
210 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  36.67 
 
 
369 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  33.91 
 
 
459 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 
369 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  36.52 
 
 
572 aa  58.9  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  39.47 
 
 
205 aa  59.3  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.29 
 
 
427 aa  58.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  35.23 
 
 
366 aa  58.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 
310 aa  58.2  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  40.37 
 
 
217 aa  58.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  40.17 
 
 
236 aa  58.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  43.68 
 
 
335 aa  58.5  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  39.81 
 
 
478 aa  58.2  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  40.24 
 
 
229 aa  58.2  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  41.25 
 
 
202 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  41.25 
 
 
202 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  37.04 
 
 
223 aa  57.8  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  39.02 
 
 
658 aa  57.8  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  40.91 
 
 
429 aa  57.4  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 
486 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 
215 aa  57  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  32.46 
 
 
315 aa  56.6  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  40.24 
 
 
261 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  32.61 
 
 
239 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  35.23 
 
 
640 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  40.24 
 
 
261 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  39.76 
 
 
630 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  43.02 
 
 
428 aa  57  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  35.23 
 
 
363 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>