74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1064 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 408 aa  787    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  44.33 
 
 		 414 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 400 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  36.77 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 426 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 399 aa  143  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  28.57 
 
 		 416 aa  136  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 411 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  28.65 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 399 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 400 aa  106  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  27.17 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 403 aa  104  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 408 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  25.82 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 404 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 386 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 416 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  27.13 
 
 		 416 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 401 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 408 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  26.15 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  23.78 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  25.2 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  25.2 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 403 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  25.36 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 404 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  28.57 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3320  hypothetical protein  31.78 
 
 		 151 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117954  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 430 aa  43.1  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  33.33 
 
 		 540 aa  43.1  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>