More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01940 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  100 
 
 		 1006 aa  2026    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  97.75 
 
 		 962 aa  1791    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  42.83 
 
 		 979 aa  661    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  44.05 
 
 		 1094 aa  746    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  43.16 
 
 		 928 aa  638    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1606  Rhs element Vgr protein  40.15 
 
 		 935 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0498  Rhs element Vgr protein  40.15 
 
 		 935 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1377  Rhs element Vgr protein  40.15 
 
 		 935 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1766  Rhs element Vgr protein  40.04 
 
 		 935 aa  602  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0659  Rhs element Vgr protein  40.15 
 
 		 935 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0855  Rhs element Vgr protein  40.04 
 
 		 935 aa  595  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1580  Rhs element Vgr protein  39.83 
 
 		 935 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7615  Rhs element Vgr protein  38.34 
 
 		 984 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2705  Rhs element Vgr protein  39.53 
 
 		 932 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2212  type VI secretion system Vgr family protein  38.76 
 
 		 981 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  44.92 
 
 		 811 aa  569  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  30.36 
 
 		 871 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  29.6 
 
 		 875 aa  313  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  29.95 
 
 		 911 aa  311  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  29.94 
 
 		 869 aa  311  5e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04713  Rhs element Vgr protein  40.54 
 
 		 564 aa  294  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  29.49 
 
 		 933 aa  291  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  30.01 
 
 		 918 aa  275  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  28.93 
 
 		 847 aa  267  8.999999999999999e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  26.49 
 
 		 958 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  27.2 
 
 		 895 aa  264  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  27.52 
 
 		 895 aa  263  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  27.4 
 
 		 891 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  30.37 
 
 		 920 aa  257  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  27.25 
 
 		 895 aa  258  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  30.38 
 
 		 920 aa  256  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  27.15 
 
 		 895 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  26.59 
 
 		 851 aa  251  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  25.87 
 
 		 1057 aa  250  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  27.36 
 
 		 850 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  25.77 
 
 		 1057 aa  244  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  30.17 
 
 		 849 aa  242  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  27.04 
 
 		 853 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  32.79 
 
 		 842 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  28.54 
 
 		 906 aa  241  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  26.58 
 
 		 892 aa  241  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  25.3 
 
 		 1059 aa  240  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  28.44 
 
 		 906 aa  238  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  27.18 
 
 		 923 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  26.4 
 
 		 853 aa  237  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  28.81 
 
 		 927 aa  234  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  25.9 
 
 		 1074 aa  233  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  26.74 
 
 		 853 aa  231  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  24.66 
 
 		 1063 aa  230  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  24.66 
 
 		 1063 aa  230  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  24.87 
 
 		 1063 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  29.35 
 
 		 947 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1111 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  27.53 
 
 		 898 aa  221  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  26.93 
 
 		 1111 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  25.6 
 
 		 852 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04712  Rhs element Vgr protein  42.73 
 
 		 336 aa  218  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  26.75 
 
 		 1111 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  26.32 
 
 		 1114 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  25.03 
 
 		 868 aa  214  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  26.93 
 
 		 1111 aa  213  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  26.36 
 
 		 850 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  26.36 
 
 		 850 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  26.19 
 
 		 850 aa  211  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  25.79 
 
 		 895 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  28.76 
 
 		 942 aa  206  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  25.1 
 
 		 885 aa  202  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  24.73 
 
 		 730 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  25.27 
 
 		 902 aa  191  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1615  Rhs element Vgr protein  28.79 
 
 		 946 aa  190  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  24.68 
 
 		 837 aa  189  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  28.69 
 
 		 946 aa  188  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  25.91 
 
 		 957 aa  187  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1590  Rhs element Vgr protein  28.69 
 
 		 946 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  25 
 
 		 822 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01531  Rhs element Vgr protein  28.86 
 
 		 892 aa  181  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  24.98 
 
 		 961 aa  180  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6904  Rhs element Vgr protein  25.32 
 
 		 928 aa  178  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  23.95 
 
 		 910 aa  178  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  25.86 
 
 		 847 aa  178  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  25.35 
 
 		 922 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  25.37 
 
 		 841 aa  174  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  24.58 
 
 		 918 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  28.17 
 
 		 661 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  27.98 
 
 		 661 aa  174  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  25.37 
 
 		 841 aa  173  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  26.75 
 
 		 614 aa  172  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  27.79 
 
 		 661 aa  172  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  24.81 
 
 		 841 aa  172  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  27.79 
 
 		 661 aa  171  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  27.79 
 
 		 661 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  27.79 
 
 		 661 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  27.79 
 
 		 661 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  27.79 
 
 		 661 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  25.47 
 
 		 843 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  25.77 
 
 		 843 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02038  Rhs element Vgr protein  30.4 
 
 		 477 aa  166  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.307189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1019 aa  165  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  24.15 
 
 		 920 aa  163  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  24.35 
 
 		 838 aa  163  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>