More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3475 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.99 
 
 
651 aa  689    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.37 
 
 
651 aa  689    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.064764  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3475  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
649 aa  1265    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.28 
 
 
641 aa  954    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640734  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3409  chemotaxis sensory transducer  58 
 
 
651 aa  682    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304746  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.9 
 
 
655 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.45 
 
 
653 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5094  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.9 
 
 
659 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.79 
 
 
573 aa  336  9e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.39 
 
 
562 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.82 
 
 
567 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  53.15 
 
 
566 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.13 
 
 
688 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  45.47 
 
 
688 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.9 
 
 
689 aa  320  6e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.79 
 
 
567 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.96 
 
 
572 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.4 
 
 
566 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  51.22 
 
 
688 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.23 
 
 
563 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  47.45 
 
 
565 aa  312  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.54 
 
 
566 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.14 
 
 
675 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.26 
 
 
561 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  50.55 
 
 
565 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  49.73 
 
 
656 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  50.41 
 
 
542 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  52.14 
 
 
552 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.61 
 
 
656 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.82 
 
 
688 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.54 
 
 
655 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  52.71 
 
 
608 aa  302  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.07 
 
 
561 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.04 
 
 
656 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.79 
 
 
673 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  49.32 
 
 
656 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  48.69 
 
 
566 aa  299  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.71 
 
 
561 aa  299  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
568 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.26 
 
 
586 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.97 
 
 
587 aa  298  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.1 
 
 
567 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.14 
 
 
670 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  47.72 
 
 
674 aa  296  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.38 
 
 
667 aa  296  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.14 
 
 
672 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  49.87 
 
 
561 aa  295  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  50 
 
 
688 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51 
 
 
674 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.87 
 
 
561 aa  294  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.19 
 
 
563 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.94 
 
 
556 aa  294  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.395485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4105  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.74 
 
 
561 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3424  chemotaxis sensory transducer  52.15 
 
 
558 aa  293  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  52.71 
 
 
558 aa  293  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0546434  normal  0.151916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.15 
 
 
558 aa  293  7e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152196  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2072  chemotaxis sensory transducer  50.67 
 
 
556 aa  293  9e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68132  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  48.1 
 
 
676 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.21 
 
 
562 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  49.47 
 
 
577 aa  292  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.88 
 
 
560 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2032  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.6 
 
 
558 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.176129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.14 
 
 
674 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.48 
 
 
563 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.72 
 
 
681 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  48.71 
 
 
691 aa  290  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0741  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.53 
 
 
558 aa  289  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.532986  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52 
 
 
698 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  49.46 
 
 
561 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.14 
 
 
568 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.67 
 
 
731 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  47.21 
 
 
565 aa  287  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  42.69 
 
 
568 aa  287  5e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  45.43 
 
 
563 aa  286  7e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.86 
 
 
567 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  46.49 
 
 
602 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.5 
 
 
563 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.86 
 
 
561 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.39 
 
 
561 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
686 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  49.19 
 
 
675 aa  283  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0568  chemotaxis sensory transducer  42.36 
 
 
662 aa  282  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.57 
 
 
730 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.34 
 
 
563 aa  281  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51 
 
 
561 aa  281  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.828703  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.59 
 
 
559 aa  281  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.50218 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.37 
 
 
561 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.73 
 
 
560 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.77 
 
 
689 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4788  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.94 
 
 
561 aa  280  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.5 
 
 
711 aa  280  7e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.47 
 
 
691 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.57 
 
 
568 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3907  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.1 
 
 
565 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  46.92 
 
 
714 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.94 
 
 
730 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.99 
 
 
561 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.3 
 
 
563 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  45.21 
 
 
712 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2363  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
695 aa  276  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>