More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1077 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  74.74 
 
 		 490 aa  739    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  98.44 
 
 		 449 aa  915    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  82.53 
 
 		 456 aa  759    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  82.77 
 
 		 498 aa  827    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  100 
 
 		 485 aa  1004    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  82.1 
 
 		 486 aa  845    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  96.91 
 
 		 485 aa  976    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  92.99 
 
 		 485 aa  948    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  72.98 
 
 		 444 aa  671    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  75.39 
 
 		 451 aa  706    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  71.93 
 
 		 488 aa  738    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  48.51 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  46.1 
 
 		 501 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  43.97 
 
 		 502 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  43.72 
 
 		 484 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  41.47 
 
 		 518 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  45.58 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  44.76 
 
 		 523 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  41.59 
 
 		 457 aa  354  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  39.62 
 
 		 525 aa  338  9e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  40.76 
 
 		 528 aa  337  2.9999999999999997e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  40.7 
 
 		 472 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  40.49 
 
 		 479 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  41.57 
 
 		 530 aa  335  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  40.43 
 
 		 502 aa  334  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  43.37 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  43.37 
 
 		 486 aa  334  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3655  putative transglycosylase  44.34 
 
 		 493 aa  334  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  43.37 
 
 		 486 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  42.17 
 
 		 485 aa  332  8e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  41.54 
 
 		 494 aa  332  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  39.02 
 
 		 534 aa  330  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  41.26 
 
 		 480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  40.09 
 
 		 494 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  39.29 
 
 		 478 aa  326  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  37.63 
 
 		 476 aa  326  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  41.93 
 
 		 486 aa  325  9e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  39.91 
 
 		 476 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  39.91 
 
 		 476 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  39.91 
 
 		 476 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  39.91 
 
 		 476 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2311  putative transglycosylase  38.83 
 
 		 478 aa  324  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.736491  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  39.06 
 
 		 478 aa  323  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  39.15 
 
 		 457 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  39.15 
 
 		 480 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  38.84 
 
 		 478 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  42.19 
 
 		 508 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1757  lytic transglycosylase, catalytic  40.05 
 
 		 471 aa  320  3e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  39.56 
 
 		 477 aa  320  5e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1230  extracellular solute-binding protein  42.03 
 
 		 470 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  38.78 
 
 		 476 aa  317  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  40.71 
 
 		 718 aa  316  5e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1222  putative transglycosylase  41.96 
 
 		 508 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  41.06 
 
 		 462 aa  313  4.999999999999999e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2712  putative transglycosylase  39.56 
 
 		 518 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3794  putative transglycosylase  39.32 
 
 		 518 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2729  putative transglycosylase  40.05 
 
 		 514 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2770  putative transglycosylase  40.05 
 
 		 514 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2833  putative transglycosylase  40.05 
 
 		 514 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.459911 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1110  Lytic transglycosylase catalytic  39.32 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1119  putative transglycosylase  39.32 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2945  putative transglycosylase  39.81 
 
 		 514 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2711  putative transglycosylase  39.32 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2924  putative transglycosylase  39.32 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02414  hypothetical protein  39.3 
 
 		 458 aa  299  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2844  putative transglycosylase  39.3 
 
 		 472 aa  298  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  38.07 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2810  putative transglycosylase  40.05 
 
 		 514 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.28375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3043  putative transglycosylase  39.59 
 
 		 517 aa  294  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.775137  normal  0.0587061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  39.06 
 
 		 467 aa  290  5.0000000000000004e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  40.53 
 
 		 511 aa  290  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0975  lytic transglycosylase catalytic  37.53 
 
 		 482 aa  281  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742746 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  36.19 
 
 		 456 aa  280  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1046  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 		 450 aa  280  4e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.872  normal  0.0396105 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0695  Lytic transglycosylase catalytic  34.71 
 
 		 523 aa  273  7e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.114922 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  35.04 
 
 		 511 aa  265  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  30.37 
 
 		 714 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 		 464 aa  187  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0175  transglycosylase SLT domain-containing protein  29.53 
 
 		 553 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0288  transglycosylase SLT domain-containing protein  31.18 
 
 		 410 aa  179  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  29.44 
 
 		 482 aa  154  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 		 505 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1582  lytic transglycosylase, catalytic  33.94 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208694 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1113  lytic transglycosylase, catalytic  32.97 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0126627  normal  0.0207439 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0182  lytic transglycosylase, catalytic  29.79 
 
 		 481 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1272  soluble lytic transglycosylase  32.97 
 
 		 402 aa  137  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1940  Lytic transglycosylase catalytic  37.55 
 
 		 581 aa  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  27.81 
 
 		 497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2792  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase-related protein  28.57 
 
 		 477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2312  lytic transglycosylase family protein  27.08 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348067 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01003  hypothetical protein  26.04 
 
 		 489 aa  120  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4020  lytic transglycosylase, catalytic  27.46 
 
 		 473 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004396  transglycosylase Slt family  25.97 
 
 		 502 aa  118  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3457  lytic transglycosylase, catalytic  27.1 
 
 		 480 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.593202  hitchhiker  0.000121257 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1506  Lytic transglycosylase catalytic  26.74 
 
 		 485 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0243609 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27050  Slt family transglycosylase  28.43 
 
 		 476 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1914  lytic transglycosylase catalytic  26.95 
 
 		 468 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260626  hitchhiker  0.00000000157074 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0787  putative transglycosylase protein  24.14 
 
 		 472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1754  lytic transglycosylase catalytic  28.03 
 
 		 468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408908 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01772  hypothetical protein  25.17 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>