More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3323 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  100 
 
 		 435 aa  896    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  60.38 
 
 		 430 aa  536  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  58.31 
 
 		 427 aa  511  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  57.58 
 
 		 429 aa  504  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  55.35 
 
 		 432 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  52.68 
 
 		 407 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  52.44 
 
 		 407 aa  443  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  43.29 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  37.47 
 
 		 438 aa  278  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  38.39 
 
 		 457 aa  276  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  43.92 
 
 		 445 aa  263  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  35.59 
 
 		 444 aa  260  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  35.06 
 
 		 440 aa  255  8e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  39.11 
 
 		 450 aa  253  6e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  38.39 
 
 		 444 aa  244  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  34.34 
 
 		 442 aa  237  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  33.64 
 
 		 440 aa  232  9e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  33.59 
 
 		 441 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  33.41 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  33.18 
 
 		 428 aa  230  3e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  33.33 
 
 		 449 aa  229  5e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  33.1 
 
 		 434 aa  229  6e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  34.82 
 
 		 436 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  35.26 
 
 		 446 aa  226  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  35.01 
 
 		 462 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  35.88 
 
 		 435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  35.88 
 
 		 435 aa  223  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  34.25 
 
 		 445 aa  222  8e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  34.62 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  33.86 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  32.43 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  34.62 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  33.26 
 
 		 435 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  31.07 
 
 		 441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  35.32 
 
 		 434 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  35.08 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  34.87 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  33.16 
 
 		 450 aa  218  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  34.1 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  34.09 
 
 		 451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  36.01 
 
 		 434 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  33.64 
 
 		 441 aa  216  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  31.6 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  34.11 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  32.56 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  34.13 
 
 		 443 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  34.99 
 
 		 450 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  31.09 
 
 		 425 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  31.03 
 
 		 429 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  30.12 
 
 		 443 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  30.12 
 
 		 440 aa  212  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  34.04 
 
 		 449 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  33.07 
 
 		 449 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  32.03 
 
 		 432 aa  211  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  32.65 
 
 		 436 aa  210  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  32.64 
 
 		 443 aa  209  7e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  33.95 
 
 		 442 aa  209  9e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  30.47 
 
 		 426 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  32.06 
 
 		 437 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  32.5 
 
 		 439 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  34.88 
 
 		 450 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  32.38 
 
 		 443 aa  207  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  32.17 
 
 		 434 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  30.39 
 
 		 441 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.07 
 
 		 428 aa  206  6e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  32.27 
 
 		 446 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  32.65 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  34.49 
 
 		 435 aa  203  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  34.45 
 
 		 434 aa  203  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  30.16 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  30.86 
 
 		 438 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  32.22 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  31.78 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  31.14 
 
 		 461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  31.98 
 
 		 461 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  28.9 
 
 		 430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  28.67 
 
 		 427 aa  200  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  30.63 
 
 		 421 aa  199  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  30.89 
 
 		 439 aa  199  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  33.82 
 
 		 454 aa  199  9e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  28.9 
 
 		 430 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  32.55 
 
 		 430 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  30.71 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  31.44 
 
 		 427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  30.56 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  30.75 
 
 		 439 aa  192  9e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  31.63 
 
 		 462 aa  192  9e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  32.65 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  31.12 
 
 		 424 aa  192  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  28.47 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  28.94 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  28.51 
 
 		 433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  28.7 
 
 		 432 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  31.3 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  28.97 
 
 		 433 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  28.74 
 
 		 433 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  30.73 
 
 		 439 aa  186  9e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  32.29 
 
 		 438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.23 
 
 		 445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  31.01 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>