More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2354 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  100 
 
 		 190 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  48.19 
 
 		 196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  49.7 
 
 		 187 aa  178  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  42.93 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  40.11 
 
 		 191 aa  140  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  40.11 
 
 		 214 aa  140  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  40.96 
 
 		 189 aa  134  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  36.53 
 
 		 194 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  37.87 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  35.26 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  32.62 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  36.32 
 
 		 184 aa  104  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  34.2 
 
 		 189 aa  104  8e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  34.2 
 
 		 189 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  34.2 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  31.58 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  33.53 
 
 		 165 aa  97.1  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  30.49 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  24.11 
 
 		 345 aa  94.7  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  31.82 
 
 		 189 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  31.49 
 
 		 274 aa  92.8  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  30.81 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  35.23 
 
 		 170 aa  92  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  28.57 
 
 		 186 aa  89  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  33.53 
 
 		 167 aa  88.6  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  32.26 
 
 		 167 aa  87.8  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  30.86 
 
 		 188 aa  87.8  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  27.93 
 
 		 275 aa  85.5  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  32.57 
 
 		 163 aa  85.1  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  30.69 
 
 		 166 aa  84.7  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.48 
 
 		 166 aa  84.3  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.89 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  30.73 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  28.86 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  30.29 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  30.69 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  29.61 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  32.94 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  31.87 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  29.47 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  25.65 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  33.91 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  29.38 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  28.99 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  30.51 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  28.65 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  30.73 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  25.98 
 
 		 287 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  31.07 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  32.47 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  31.94 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  27.49 
 
 		 275 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  31.09 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 171 aa  77.4  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.08 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  29.69 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.84 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  30.06 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  30.46 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.21 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  29.19 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  27.43 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  28.19 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  28.22 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  30.18 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  29.44 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  31.58 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  28.74 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  31.46 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  28.34 
 
 		 274 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  32.52 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  26.37 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  27.62 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2018  nitroreductase  30.64 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  27.42 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  28.73 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  27.89 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  28.65 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  25.7 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  29.89 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  28.4 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.41 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4461  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.54 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.219812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  26.34 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  25 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  29.07 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  27.27 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.14 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  27.37 
 
 		 275 aa  72  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  29.15 
 
 		 446 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  27.88 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1518  nitroreductase  32.95 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  hitchhiker  0.00282354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  28.12 
 
 		 172 aa  72  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  24.57 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  28.74 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  26.82 
 
 		 458 aa  71.6  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  24.08 
 
 		 274 aa  71.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  28.07 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  28.02 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>