More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1946 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  52.17 
 
 
640 aa  650    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  100 
 
 
631 aa  1290    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  54.17 
 
 
618 aa  670    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  53.97 
 
 
635 aa  678    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  55.18 
 
 
623 aa  669    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  53.97 
 
 
635 aa  678    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  44.08 
 
 
648 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  42.35 
 
 
653 aa  498  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  32.09 
 
 
630 aa  298  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  32.13 
 
 
621 aa  286  8e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  31 
 
 
629 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  31.41 
 
 
624 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  30.94 
 
 
626 aa  273  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  30.86 
 
 
614 aa  261  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  29.43 
 
 
606 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  29.74 
 
 
612 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  30.97 
 
 
689 aa  246  8e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  28.62 
 
 
624 aa  244  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4832  transketolase  29.72 
 
 
639 aa  240  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  49.43 
 
 
282 aa  240  6.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  48.86 
 
 
273 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  44.73 
 
 
274 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  28.82 
 
 
627 aa  234  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  47.74 
 
 
269 aa  233  6e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  44 
 
 
274 aa  231  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  46.67 
 
 
281 aa  230  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  28.95 
 
 
622 aa  229  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  44.94 
 
 
279 aa  224  4e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  45.15 
 
 
272 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  43.77 
 
 
277 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  45.76 
 
 
271 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  44.94 
 
 
272 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  43.91 
 
 
271 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  46.67 
 
 
273 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  45.35 
 
 
281 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  45.22 
 
 
271 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  47.13 
 
 
284 aa  213  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  44.48 
 
 
286 aa  212  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0338  transketolase  29.7 
 
 
639 aa  210  5e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.025251  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  43.66 
 
 
275 aa  207  5e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0851  transketolase  28.42 
 
 
660 aa  206  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149061  normal  0.206532 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  42.22 
 
 
275 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1636  transketolase  30.48 
 
 
632 aa  206  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1817  transketolase  30.63 
 
 
632 aa  204  3e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  31.42 
 
 
660 aa  203  6e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  30.22 
 
 
632 aa  203  8e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  42.96 
 
 
286 aa  203  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  42.86 
 
 
274 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  41.48 
 
 
275 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  42.86 
 
 
274 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  40.37 
 
 
275 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  27.22 
 
 
592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  42.59 
 
 
277 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  42.12 
 
 
273 aa  198  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  40.81 
 
 
276 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  42.48 
 
 
273 aa  196  8.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  28.01 
 
 
667 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  43.41 
 
 
275 aa  196  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  27.74 
 
 
668 aa  196  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  29.45 
 
 
664 aa  195  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  28.57 
 
 
656 aa  195  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  31.13 
 
 
682 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  42.45 
 
 
297 aa  194  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  39.16 
 
 
297 aa  194  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  30.19 
 
 
634 aa  194  5e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  29.44 
 
 
679 aa  194  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  28.24 
 
 
668 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  28.02 
 
 
653 aa  192  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  28.13 
 
 
660 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  28.38 
 
 
671 aa  191  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  31.53 
 
 
684 aa  191  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  27.84 
 
 
671 aa  191  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  27.9 
 
 
661 aa  190  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  30.96 
 
 
695 aa  190  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  28.16 
 
 
666 aa  189  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1193  transketolase  28.55 
 
 
667 aa  189  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  29.03 
 
 
663 aa  189  2e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  28.84 
 
 
663 aa  189  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  39.41 
 
 
275 aa  187  7e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  27.94 
 
 
662 aa  186  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  38.43 
 
 
288 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  29.98 
 
 
661 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  26.94 
 
 
666 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  27.52 
 
 
633 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3765  transketolase  28.78 
 
 
659 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  29.16 
 
 
690 aa  186  2.0000000000000003e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  27.73 
 
 
666 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  27.62 
 
 
699 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  29.44 
 
 
665 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0353  transketolase  27.93 
 
 
663 aa  184  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1865  transketolase  29.31 
 
 
657 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  28.63 
 
 
659 aa  183  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0220  transketolase  27.25 
 
 
681 aa  182  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103383 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  37.99 
 
 
303 aa  182  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  30.07 
 
 
672 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2748  transketolase  28.55 
 
 
690 aa  182  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.495668 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  28.09 
 
 
665 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0202  transketolase  28.35 
 
 
636 aa  182  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  36.46 
 
 
299 aa  182  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  26.79 
 
 
666 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>