More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3318 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1253  DNA ligase, NAD-dependent  49.85 
 
 		 669 aa  667    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5111  DNA ligase, NAD-dependent  53.76 
 
 		 695 aa  731    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246917  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1926  hypothetical protein  47.7 
 
 		 671 aa  635    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3318  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 670 aa  1385    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.563923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2539  DNA ligase, NAD-dependent  51.82 
 
 		 696 aa  719    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173328 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  56.13 
 
 		 662 aa  761    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3475  DNA ligase, NAD-dependent  55.04 
 
 		 668 aa  759    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.502596  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1313  DNA ligase  56.72 
 
 		 670 aa  782    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.269353 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09423  DNA ligase  54.44 
 
 		 664 aa  741    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.624424  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  46.43 
 
 		 681 aa  587  1e-166  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.34 
 
 		 670 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  45.66 
 
 		 670 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0427  DNA ligase, NAD-dependent  44.31 
 
 		 675 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  44.49 
 
 		 672 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0275  NAD-dependent DNA ligase  43.52 
 
 		 667 aa  571  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0483  DNA ligase, NAD-dependent  42.73 
 
 		 674 aa  571  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  42.77 
 
 		 672 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0592  DNA ligase, NAD-dependent  44.8 
 
 		 669 aa  552  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0475  DNA ligase, NAD-dependent  41.3 
 
 		 676 aa  555  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.92 
 
 		 669 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  42.86 
 
 		 663 aa  548  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.77 
 
 		 669 aa  549  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.92 
 
 		 669 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.92 
 
 		 669 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  42.92 
 
 		 673 aa  551  1e-155  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.05 
 
 		 670 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.32 
 
 		 669 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.92 
 
 		 669 aa  547  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.77 
 
 		 669 aa  546  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.77 
 
 		 669 aa  545  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.77 
 
 		 669 aa  547  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  42.92 
 
 		 670 aa  548  1e-154  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.07 
 
 		 679 aa  545  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0463  DNA ligase, NAD-dependent  41.72 
 
 		 684 aa  545  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.62 
 
 		 669 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  41.96 
 
 		 678 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.92 
 
 		 669 aa  545  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  43.48 
 
 		 665 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2016  DNA ligase, NAD-dependent  42.51 
 
 		 673 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  42.86 
 
 		 677 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  44.68 
 
 		 662 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0947  DNA ligase, NAD-dependent  44.87 
 
 		 675 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.42 
 
 		 676 aa  537  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  41.7 
 
 		 675 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  44.21 
 
 		 673 aa  536  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  42.66 
 
 		 659 aa  533  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  41.96 
 
 		 706 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  42.9 
 
 		 670 aa  530  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  41.03 
 
 		 668 aa  531  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  39.85 
 
 		 711 aa  531  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  41.15 
 
 		 671 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  42.94 
 
 		 662 aa  529  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.55 
 
 		 738 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  41.07 
 
 		 663 aa  529  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  41.92 
 
 		 667 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  40.81 
 
 		 671 aa  528  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  42.29 
 
 		 674 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  41.92 
 
 		 667 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  40.87 
 
 		 668 aa  527  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29061  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.17 
 
 		 696 aa  525  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  40.65 
 
 		 672 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  40.39 
 
 		 683 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  39.59 
 
 		 726 aa  520  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  43.28 
 
 		 688 aa  522  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  41.46 
 
 		 684 aa  520  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  41.24 
 
 		 671 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  39.39 
 
 		 718 aa  522  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3405  DNA ligase, NAD-dependent  40.48 
 
 		 672 aa  521  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.558724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  40.71 
 
 		 685 aa  519  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.46 
 
 		 774 aa  521  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  40.81 
 
 		 678 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  43.28 
 
 		 688 aa  522  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  41.83 
 
 		 674 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  41.24 
 
 		 671 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  40.66 
 
 		 689 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.63 
 
 		 680 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.55 
 
 		 680 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  41.22 
 
 		 666 aa  515  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  38.71 
 
 		 681 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0351  DNA ligase, NAD-dependent  40.72 
 
 		 691 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  40.66 
 
 		 690 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  37.91 
 
 		 673 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1227  DNA ligase, NAD-dependent  41.23 
 
 		 656 aa  518  1.0000000000000001e-145  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  39.31 
 
 		 670 aa  512  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  39.27 
 
 		 708 aa  512  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1699  DNA ligase (NAD+)  42.12 
 
 		 677 aa  512  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.699894  normal  0.700726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  37.94 
 
 		 703 aa  514  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  39.7 
 
 		 674 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  38.48 
 
 		 697 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2514  DNA ligase, NAD-dependent  40.21 
 
 		 670 aa  514  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00116351  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  38.81 
 
 		 721 aa  515  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  40.66 
 
 		 690 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.34 
 
 		 669 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  40.81 
 
 		 691 aa  513  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  39.48 
 
 		 708 aa  509  1e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0894  DNA ligase, NAD-dependent  41.09 
 
 		 700 aa  510  1e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  39.64 
 
 		 682 aa  510  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  39.85 
 
 		 690 aa  512  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2461  DNA ligase, NAD-dependent  40.03 
 
 		 670 aa  511  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  40.06 
 
 		 685 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>