250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3007 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  100 
 
 		 318 aa  659    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  46.62 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  43.14 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  42.29 
 
 		 319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  36.04 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  33.45 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  33.45 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  32.77 
 
 		 386 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  32.77 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  37.59 
 
 		 325 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  32.66 
 
 		 393 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  33.9 
 
 		 347 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  32.12 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  34.29 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  36.47 
 
 		 341 aa  146  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  32.91 
 
 		 346 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  32.68 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  33.56 
 
 		 346 aa  142  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  33.79 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  32.27 
 
 		 346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  31.08 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  33.55 
 
 		 330 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  29.37 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  31.25 
 
 		 341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  31.03 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  28.42 
 
 		 574 aa  108  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  34.59 
 
 		 323 aa  108  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  33.65 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  30.67 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  31.8 
 
 		 555 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  32.98 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  33.33 
 
 		 424 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  37.65 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  32.43 
 
 		 546 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  30.48 
 
 		 598 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  32.62 
 
 		 420 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  28.64 
 
 		 674 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  33.33 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  33.17 
 
 		 531 aa  95.9  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  32.71 
 
 		 533 aa  95.9  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  30.45 
 
 		 579 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  31.87 
 
 		 944 aa  89.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  29.35 
 
 		 623 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  31.8 
 
 		 550 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  35.44 
 
 		 552 aa  87.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  27.97 
 
 		 528 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  30.59 
 
 		 422 aa  86.3  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  28.17 
 
 		 491 aa  85.9  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  27.64 
 
 		 539 aa  85.9  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  42.2 
 
 		 434 aa  85.9  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  31.58 
 
 		 532 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  31.58 
 
 		 540 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  31.58 
 
 		 540 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  31.72 
 
 		 540 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  31.74 
 
 		 529 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  31.58 
 
 		 541 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  26.09 
 
 		 603 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  30.28 
 
 		 552 aa  83.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  27.17 
 
 		 563 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  30.3 
 
 		 503 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  30.41 
 
 		 552 aa  83.2  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  37.04 
 
 		 529 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  32.49 
 
 		 541 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  32.49 
 
 		 541 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  25.94 
 
 		 1103 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  27.34 
 
 		 545 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  28.51 
 
 		 552 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  41.51 
 
 		 528 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  33.86 
 
 		 560 aa  80.9  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  26.45 
 
 		 571 aa  80.9  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  29.82 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  41.51 
 
 		 532 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  31.98 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  29.58 
 
 		 549 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  29.73 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  30.41 
 
 		 555 aa  77.8  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  31.21 
 
 		 546 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  31.05 
 
 		 552 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  29.58 
 
 		 556 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  29.29 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  35 
 
 		 563 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  43.43 
 
 		 553 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  28.27 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  26.39 
 
 		 591 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  32.16 
 
 		 1247 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  25 
 
 		 567 aa  75.1  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  23.57 
 
 		 512 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  28.1 
 
 		 551 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  27.78 
 
 		 548 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  33.33 
 
 		 514 aa  73.2  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  39.62 
 
 		 548 aa  72.8  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  27.82 
 
 		 522 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  30.56 
 
 		 569 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  29.02 
 
 		 575 aa  72.4  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  28.37 
 
 		 490 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  29.02 
 
 		 550 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  29.1 
 
 		 557 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  25.88 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  28.57 
 
 		 557 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  31.07 
 
 		 552 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>