73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2672 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  50.66 
 
 
1145 aa  1077    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
1140 aa  2323    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  44.84 
 
 
451 aa  360  9.999999999999999e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2273  hypothetical protein  34.52 
 
 
482 aa  244  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43278  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  31.96 
 
 
241 aa  102  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  34.06 
 
 
247 aa  99.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  30.66 
 
 
222 aa  94.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  31.48 
 
 
230 aa  93.6  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  26.67 
 
 
453 aa  93.6  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  26.92 
 
 
455 aa  91.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  29.72 
 
 
260 aa  89.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  30.09 
 
 
239 aa  88.6  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  26.17 
 
 
440 aa  88.6  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  27.76 
 
 
308 aa  84  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  31.46 
 
 
238 aa  84  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  24.05 
 
 
453 aa  81.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  31.19 
 
 
242 aa  80.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  27.96 
 
 
239 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  24.52 
 
 
452 aa  79.7  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  28.64 
 
 
257 aa  79.3  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  26.73 
 
 
240 aa  79  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  27.48 
 
 
237 aa  76.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  30.14 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  31.34 
 
 
231 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  29.36 
 
 
240 aa  72.4  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  26.75 
 
 
352 aa  71.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  30.28 
 
 
261 aa  70.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3508  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  21.3 
 
 
764 aa  68.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0541197  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  23.68 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  29.06 
 
 
326 aa  67.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.22 
 
 
1505 aa  67.4  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  27.23 
 
 
247 aa  67  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.97 
 
 
1343 aa  64.7  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  29.39 
 
 
226 aa  65.1  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  28.63 
 
 
1194 aa  64.3  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  25.25 
 
 
1094 aa  64.3  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  23.21 
 
 
959 aa  63.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  24.65 
 
 
451 aa  63.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  28.08 
 
 
212 aa  63.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  26.15 
 
 
1444 aa  61.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  25.73 
 
 
209 aa  61.6  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  31.93 
 
 
321 aa  60.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  25.45 
 
 
217 aa  60.1  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  24.43 
 
 
501 aa  59.7  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0813  protein of unknown function DUF1080  28.05 
 
 
240 aa  59.7  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  22.62 
 
 
268 aa  59.3  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  30.18 
 
 
272 aa  59.3  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  25.53 
 
 
258 aa  58.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  20.5 
 
 
254 aa  58.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  26.6 
 
 
322 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  28.97 
 
 
216 aa  57  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  26.37 
 
 
259 aa  57  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  26.44 
 
 
254 aa  56.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  22.47 
 
 
493 aa  55.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  22.49 
 
 
1148 aa  55.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  23.92 
 
 
255 aa  55.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  27.8 
 
 
218 aa  55.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.47 
 
 
510 aa  53.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  28.93 
 
 
211 aa  52  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  25.57 
 
 
198 aa  52  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  22.75 
 
 
1224 aa  52  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  26.04 
 
 
260 aa  51.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  24.46 
 
 
558 aa  50.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  27.44 
 
 
198 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  25.1 
 
 
259 aa  49.7  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  25.25 
 
 
197 aa  49.7  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  25.47 
 
 
501 aa  48.9  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.46 
 
 
370 aa  48.5  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  25.31 
 
 
259 aa  48.5  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.18 
 
 
320 aa  46.6  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  24.3 
 
 
212 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1162  protein of unknown function DUF1080  26.59 
 
 
253 aa  45.1  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  23.91 
 
 
1181 aa  45.1  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>