More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1596 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  100 
 
 		 660 aa  1345    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1714  ATP-binding region ATPase domain protein  50.07 
 
 		 666 aa  620  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84327  hitchhiker  0.000293695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  25.98 
 
 		 795 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 663 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  25.41 
 
 		 668 aa  198  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.04 
 
 		 782 aa  198  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.35 
 
 		 802 aa  195  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.8 
 
 		 662 aa  193  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  25.15 
 
 		 677 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 662 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203793  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 662 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.84 
 
 		 914 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  23.14 
 
 		 914 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  27.12 
 
 		 715 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  26.26 
 
 		 730 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  27.97 
 
 		 724 aa  145  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  23.85 
 
 		 918 aa  143  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.64 
 
 		 644 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00181069  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  25.23 
 
 		 726 aa  140  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  23.09 
 
 		 918 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3961  histidine kinase  34.38 
 
 		 475 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321682  normal  0.0949422 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  25.25 
 
 		 708 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  35.54 
 
 		 667 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2797  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  25.25 
 
 		 707 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000203115  normal  0.0370017 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  26.49 
 
 		 565 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6429  response regulator receiver protein  26.46 
 
 		 553 aa  128  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3285  ATP-binding region ATPase domain protein  31.97 
 
 		 588 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255364 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 407 aa  126  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.512504  normal  0.0507183 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6422  histidine kinase  35.47 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0345  histidine kinase  34.65 
 
 		 454 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0306383  normal  0.0156916 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.8 
 
 		 686 aa  121  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3541  sensor kinase of copper sensing two-component system  30.95 
 
 		 448 aa  120  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0485338  normal  0.197924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6490  ATP-binding region ATPase domain protein  25.23 
 
 		 636 aa  119  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1222  signal transduction histidine kinase  22.03 
 
 		 650 aa  117  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3844  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.08 
 
 		 867 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1523  ATP-binding region ATPase domain protein  33.88 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925921  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  23.22 
 
 		 1042 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1456  diguanylate cyclase  24.11 
 
 		 636 aa  114  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1613  histidine kinase  31.14 
 
 		 594 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000260533  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  24.37 
 
 		 614 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.01 
 
 		 1045 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3468  sensor histidine kinase  21.04 
 
 		 651 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2871  response regulator  25.71 
 
 		 564 aa  112  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 387 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6950  histidine kinase  29.41 
 
 		 721 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0762  ATP-binding region ATPase domain protein  31.73 
 
 		 630 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  24.2 
 
 		 630 aa  107  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6126  histidine kinase  29.79 
 
 		 628 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2799  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  23.44 
 
 		 716 aa  106  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000869  normal  0.160664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2800  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  23.15 
 
 		 696 aa  104  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120614  normal  0.163305 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5059  histidine kinase  32.6 
 
 		 614 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00156812  normal  0.0126668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  21.54 
 
 		 945 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1906  response regulator receiver domain-containing protein  25.06 
 
 		 603 aa  103  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1098  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.31 
 
 		 633 aa  103  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0013981  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  25.8 
 
 		 631 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 673 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2730  diguanylate cyclase  24.71 
 
 		 638 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.814579  normal  0.595433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  22.99 
 
 		 612 aa  102  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5226  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 388 aa  101  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5597  Diverse 7TM receptor transmembrane region  24.83 
 
 		 634 aa  100  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4218  diguanylate cyclase  24.45 
 
 		 631 aa  99.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.86 
 
 		 1182 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.84 
 
 		 1797 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1190  histidine kinase  24.72 
 
 		 646 aa  98.6  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 576 aa  98.2  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0992  two-component sensor histidine kinase  22.67 
 
 		 696 aa  97.8  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0439814  normal  0.153335 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3381  diguanylate cyclase  26.33 
 
 		 622 aa  96.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  20.99 
 
 		 696 aa  96.3  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3540  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  31 
 
 		 446 aa  96.3  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.168985  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4358  Diverse 7TM receptor transmembrane region  22.54 
 
 		 600 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934126  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  24.34 
 
 		 1414 aa  94.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 389 aa  94  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3210  GGDEF domain-containing protein  25.78 
 
 		 624 aa  93.2  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  22.2 
 
 		 578 aa  92.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0223  sensor histidine kinase  23.61 
 
 		 655 aa  92.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.142406  normal  0.0289163 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  23.35 
 
 		 611 aa  93.2  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.49 
 
 		 773 aa  92  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.28125 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 461 aa  91.3  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2693  diguanylate cyclase  23.12 
 
 		 570 aa  90.9  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.62 
 
 		 1068 aa  90.9  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00565  Signaling protein with a acyltransferase and GGDEF domains  24.26 
 
 		 628 aa  90.9  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0691  adaptive-response sensory kinase  27.17 
 
 		 387 aa  90.5  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.19 
 
 		 614 aa  90.1  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3728  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.67 
 
 		 750 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3800  diguanylate cyclase  21.58 
 
 		 621 aa  89.7  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1062  diguanylate cyclase  24.3 
 
 		 566 aa  89.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0191664  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0190  histidine kinase  28.34 
 
 		 472 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.393808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 1291 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4293  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.29 
 
 		 1011 aa  88.6  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.291525  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2035  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.67 
 
 		 750 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 606 aa  87.8  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  26.43 
 
 		 535 aa  88.2  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 418 aa  87.8  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2178  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.41 
 
 		 750 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00477296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2121  histidine kinase  26.27 
 
 		 420 aa  87.4  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 412 aa  87  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1810  PAS sensor protein  26.41 
 
 		 829 aa  87  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.2 
 
 		 680 aa  86.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4050  adaptive-response sensory kinase  26.48 
 
 		 412 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588748  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3589  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.19 
 
 		 853 aa  86.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>