More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2577 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2577  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 240 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2270  short chain dehydrogenase  92.47 
 
 		 240 aa  454  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2589  short chain dehydrogenase  73.33 
 
 		 240 aa  361  7.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1846  short chain dehydrogenase  68.97 
 
 		 240 aa  332  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1793  short chain dehydrogenase  65.24 
 
 		 240 aa  317  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0661152  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1815  short chain dehydrogenase  65.24 
 
 		 240 aa  317  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00999645  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01575  short chain dehydrogenase  65.24 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2037  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.24 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00181892  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1681  short chain dehydrogenase  65.24 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.290882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1592  short chain dehydrogenase  65.67 
 
 		 240 aa  317  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0574635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2024  short chain dehydrogenase  65.24 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01565  hypothetical protein  65.24 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.740406  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2317  short chain dehydrogenase  65.24 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.186144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3683  short chain dehydrogenase  51.21 
 
 		 248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3337  short chain dehydrogenase  51.46 
 
 		 239 aa  241  9e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.212049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3507  short chain dehydrogenase  51.46 
 
 		 239 aa  241  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.430968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0048  short chain dehydrogenase  51.72 
 
 		 235 aa  238  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3625  short chain dehydrogenase  50.4 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3807  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0169066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0611  short chain dehydrogenase  49.6 
 
 		 248 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0577388  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0616  short chain dehydrogenase  50.63 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689815  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0772  short chain dehydrogenase  51.24 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.72 
 
 		 240 aa  232  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3217  short chain dehydrogenase  49.37 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00454323  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3161  short chain dehydrogenase  49.16 
 
 		 252 aa  228  6e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1183  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  49.37 
 
 		 236 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0827  short chain dehydrogenase  47.35 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1021  short chain dehydrogenase  47.7 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1691  short chain dehydrogenase  48.13 
 
 		 234 aa  218  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0587  short chain dehydrogenase  46.89 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19640  short chain dehydrogenase  47.72 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0892  short chain dehydrogenase  47.48 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00674  short chain dehydrogenase  50.76 
 
 		 194 aa  203  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10270  short chain dehydrogenase  46 
 
 		 262 aa  202  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3288  short chain dehydrogenase  44.77 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1865  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000200406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0808  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4632  short chain dehydrogenase  39.17 
 
 		 245 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4493  short chain dehydrogenase  38.3 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4617  short chain dehydrogenase  38.3 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2118  Dihydrofolate reductase  41.1 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  37.76 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  32.26 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  33.74 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 246 aa  121  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 		 367 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  30.65 
 
 		 249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0726  pteridine reductase  34.43 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.12 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4223  short chain dehydrogenase/reductase family protein  27.47 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0790726 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  30.17 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  31.56 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  31.56 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 		 264 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  34.31 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  30.42 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  34.31 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  30.96 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  34.25 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.317588 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02553  hypothetical protein  29.05 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1369  pteridine reductase  31.76 
 
 		 267 aa  102  8e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000175176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0696  pteridine reductase  30.36 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.454716  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  31.82 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.99 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 		 273 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  0.457646 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  30.83 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0995  pteridine reductase  29.88 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0277156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52827  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3521  oxidoreductase  31.62 
 
 		 253 aa  92.4  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.15 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0985311  hitchhiker  0.000033531 
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  27.57 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  29.66 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  27.57 
 
 		 331 aa  90.1  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1941  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.38 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0923131  normal  0.859754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 		 247 aa  89  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.78 
 
 		 248 aa  89.4  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.82 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1559  dehydrogenase  28.87 
 
 		 259 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  28.15 
 
 		 251 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 		 254 aa  85.5  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 		 257 aa  85.5  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.129082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.1 
 
 		 247 aa  85.1  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.23 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.49 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0345  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.93 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2801  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.17 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>