87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1811 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1444  SMC domain-containing protein  65.65 
 
 		 795 aa  971    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 794 aa  1538    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  61.71 
 
 		 795 aa  950    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  64.97 
 
 		 790 aa  988    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  29.64 
 
 		 805 aa  284  4.0000000000000003e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  26.68 
 
 		 784 aa  154  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  28.8 
 
 		 702 aa  101  6e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  28.68 
 
 		 702 aa  92.4  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  26.8 
 
 		 702 aa  92  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  23.13 
 
 		 858 aa  91.7  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  23.36 
 
 		 961 aa  84.7  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  21.12 
 
 		 864 aa  81.6  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  24.38 
 
 		 891 aa  69.3  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  23.53 
 
 		 906 aa  67.8  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  29.89 
 
 		 804 aa  66.6  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  23.93 
 
 		 926 aa  65.5  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  24.35 
 
 		 993 aa  65.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  29.29 
 
 		 700 aa  65.1  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  23.39 
 
 		 895 aa  65.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  22.38 
 
 		 978 aa  65.1  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  23.48 
 
 		 993 aa  62.4  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  23.99 
 
 		 987 aa  62.4  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  24.26 
 
 		 987 aa  61.6  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  26.52 
 
 		 1029 aa  61.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  27.88 
 
 		 924 aa  60.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  23.28 
 
 		 993 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  21.72 
 
 		 875 aa  57.4  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  24.18 
 
 		 813 aa  57  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  23.7 
 
 		 857 aa  57  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  23.62 
 
 		 814 aa  55.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  22 
 
 		 1019 aa  55.1  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  26.6 
 
 		 1023 aa  54.7  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  29.38 
 
 		 989 aa  54.3  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  23.16 
 
 		 1030 aa  53.9  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  28.33 
 
 		 724 aa  53.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  26.9 
 
 		 910 aa  52.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  21.19 
 
 		 1039 aa  53.1  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  23.27 
 
 		 994 aa  52.4  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  28.74 
 
 		 1074 aa  51.6  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1688  hypothetical protein  23.86 
 
 		 427 aa  52  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00694516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  30.22 
 
 		 962 aa  51.6  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  26.37 
 
 		 1025 aa  51.2  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  34.62 
 
 		 369 aa  51.2  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1186 aa  50.8  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  24.7 
 
 		 371 aa  50.8  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  23.68 
 
 		 1059 aa  50.4  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  25 
 
 		 888 aa  50.4  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  27.46 
 
 		 986 aa  50.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0003  recombination protein F  30.69 
 
 		 379 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  23.68 
 
 		 642 aa  49.3  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 935 aa  49.3  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  22.44 
 
 		 483 aa  49.3  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  26.39 
 
 		 1063 aa  48.9  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30705  predicted protein  38.46 
 
 		 1225 aa  48.5  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  23.74 
 
 		 1016 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28736  predicted protein  25.33 
 
 		 1313 aa  48.5  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51876  Rad50 DNA repair/recombination protein  24.26 
 
 		 1436 aa  48.5  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02640  cohesin complex subunit psm1, putative  38.46 
 
 		 1202 aa  48.5  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  24.42 
 
 		 1029 aa  47.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03619  subunit of MRX complex (Eurofung)  22.3 
 
 		 1319 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.296767 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1750  SMC domain protein  22.46 
 
 		 445 aa  47.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.524117  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  23.2 
 
 		 859 aa  47  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  21.67 
 
 		 859 aa  47  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  26.46 
 
 		 1061 aa  47  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  21.67 
 
 		 859 aa  47  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  24.07 
 
 		 1180 aa  46.2  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  22.58 
 
 		 806 aa  46.6  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  36.25 
 
 		 351 aa  46.2  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  26.27 
 
 		 1020 aa  46.6  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  24.8 
 
 		 890 aa  47  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  35 
 
 		 995 aa  45.8  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  25.42 
 
 		 851 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  21.76 
 
 		 904 aa  45.8  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  24.14 
 
 		 1023 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  44.07 
 
 		 666 aa  45.8  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  32.14 
 
 		 984 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53629  DNA repair protein  23.76 
 
 		 1306 aa  45.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.440366 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02963  subunit of the multiprotein cohesin complex (Eurofung)  34.12 
 
 		 1261 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.869659  normal  0.319828 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  24.51 
 
 		 353 aa  45.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  27.27 
 
 		 955 aa  45.4  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  28.5 
 
 		 995 aa  45.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  28.24 
 
 		 676 aa  45.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  28.36 
 
 		 829 aa  44.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  25.22 
 
 		 852 aa  44.7  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  24.26 
 
 		 690 aa  44.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  41.51 
 
 		 699 aa  44.3  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  38.3 
 
 		 802 aa  44.3  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>