18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51876 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_51876  Rad50 DNA repair/recombination protein  100 
 
 		 1436 aa  2955    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53629  DNA repair protein  34.62 
 
 		 1306 aa  242  2.9999999999999997e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.440366 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28736  predicted protein  28.78 
 
 		 1313 aa  231  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03619  subunit of MRX complex (Eurofung)  39.02 
 
 		 1319 aa  223  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.296767 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01100  telomere maintenance protein, putative  46.47 
 
 		 1289 aa  216  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.28116  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  30.95 
 
 		 891 aa  61.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  24.92 
 
 		 864 aa  57  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  29.9 
 
 		 693 aa  51.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  35.29 
 
 		 813 aa  50.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  32.88 
 
 		 993 aa  48.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 993 aa  48.5  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 993 aa  48.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  30 
 
 		 858 aa  48.5  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  34.25 
 
 		 1019 aa  48.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  30.38 
 
 		 275 aa  45.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1760  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  32.29 
 
 		 226 aa  45.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  31.51 
 
 		 994 aa  45.1  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  34.69 
 
 		 814 aa  45.1  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>