More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0148 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  77.56 
 
 		 878 aa  1444    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 878 aa  1791    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2667  alpha amylase catalytic region  71.83 
 
 		 853 aa  889    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  77.79 
 
 		 878 aa  1446    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  34.62 
 
 		 997 aa  301  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  29.61 
 
 		 600 aa  158  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  25.19 
 
 		 571 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  27.67 
 
 		 609 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.15 
 
 		 1975 aa  144  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  26.86 
 
 		 599 aa  137  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  25.81 
 
 		 593 aa  134  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.08 
 
 		 1855 aa  128  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  29.16 
 
 		 1942 aa  128  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  27.13 
 
 		 723 aa  126  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  27.94 
 
 		 614 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  26.39 
 
 		 604 aa  124  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  26.67 
 
 		 622 aa  122  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  26.55 
 
 		 1017 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  27.9 
 
 		 925 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  24.65 
 
 		 767 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  29.29 
 
 		 642 aa  108  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  24.36 
 
 		 610 aa  107  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  26.78 
 
 		 2638 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  31.36 
 
 		 838 aa  100  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  36.31 
 
 		 649 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  23.62 
 
 		 659 aa  94.7  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  39.29 
 
 		 676 aa  94.4  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  27.27 
 
 		 694 aa  93.6  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  39.29 
 
 		 676 aa  93.6  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  39.29 
 
 		 676 aa  93.6  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  39.29 
 
 		 676 aa  93.6  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  39.29 
 
 		 676 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  39.29 
 
 		 676 aa  93.2  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  39.29 
 
 		 676 aa  93.6  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  39.29 
 
 		 676 aa  93.6  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  39.29 
 
 		 676 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  39.29 
 
 		 676 aa  93.6  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  23.49 
 
 		 655 aa  92.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  41.67 
 
 		 630 aa  92  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  40.85 
 
 		 690 aa  92.4  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  36.36 
 
 		 885 aa  91.7  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  39.06 
 
 		 510 aa  91.3  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  37.86 
 
 		 675 aa  90.9  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  42.38 
 
 		 2068 aa  90.5  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  26.87 
 
 		 687 aa  90.1  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  37.86 
 
 		 675 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.973795 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  23.94 
 
 		 741 aa  90.5  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  37.86 
 
 		 675 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  43.7 
 
 		 1891 aa  90.5  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  37.86 
 
 		 675 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3987  periplasmic alpha-amylase precursor  37.86 
 
 		 675 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  26.87 
 
 		 687 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  23.43 
 
 		 650 aa  89.7  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  26.87 
 
 		 687 aa  90.1  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  38.46 
 
 		 752 aa  89.7  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  39.42 
 
 		 687 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  38.93 
 
 		 836 aa  89.4  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  36.18 
 
 		 511 aa  89  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  35.51 
 
 		 688 aa  89.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  41.41 
 
 		 524 aa  89  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  23.85 
 
 		 774 aa  88.2  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  39.01 
 
 		 686 aa  87.8  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  24.03 
 
 		 786 aa  88.2  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  26.32 
 
 		 564 aa  87.4  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  31.05 
 
 		 641 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  23.56 
 
 		 665 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  28.53 
 
 		 686 aa  86.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  24.41 
 
 		 778 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  37.31 
 
 		 1005 aa  85.5  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  35.81 
 
 		 683 aa  84.3  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  33.57 
 
 		 742 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  31.87 
 
 		 793 aa  84  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  38.41 
 
 		 654 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  38.52 
 
 		 814 aa  83.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  37.16 
 
 		 1021 aa  83.2  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  30.14 
 
 		 631 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  43.85 
 
 		 620 aa  83.2  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  33.33 
 
 		 665 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  22.98 
 
 		 765 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  36.36 
 
 		 639 aa  82  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  30.68 
 
 		 553 aa  80.5  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  29.72 
 
 		 622 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  39.1 
 
 		 526 aa  80.1  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  39.13 
 
 		 1048 aa  80.1  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  31.47 
 
 		 646 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  34.93 
 
 		 619 aa  78.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  36.07 
 
 		 686 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  38.52 
 
 		 739 aa  78.6  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  23.23 
 
 		 617 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  24.13 
 
 		 558 aa  77.8  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  31.47 
 
 		 662 aa  77.8  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  36.84 
 
 		 528 aa  77.4  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  34.01 
 
 		 644 aa  77.4  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  35.38 
 
 		 490 aa  77.4  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  23.42 
 
 		 541 aa  77.4  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  36.09 
 
 		 528 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  26.63 
 
 		 703 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  38.89 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  34.59 
 
 		 533 aa  75.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  35.25 
 
 		 566 aa  75.5  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>