99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2790 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2790  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
119 aa  246  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.185458 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 
792 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.73 
 
 
746 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.08 
 
 
1274 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
762 aa  60.1  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.08 
 
 
736 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
827 aa  58.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.81 
 
 
757 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3334  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 
297 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
559 aa  50.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  41.54 
 
 
634 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5400  hypothetical protein  40.35 
 
 
397 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3354  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
949 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129788  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 
686 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 
613 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 
667 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  32.63 
 
 
335 aa  47.8  0.00006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 
734 aa  47.8  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.17 
 
 
384 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2243  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
311 aa  47.4  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.1 
 
 
882 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2507  hypothetical protein  41.07 
 
 
428 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.12 
 
 
878 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
574 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
618 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.1 
 
 
882 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
968 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1499  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.88 
 
 
494 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
878 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0926  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0811  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.74 
 
 
810 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
274 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 
739 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  32.89 
 
 
437 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1955  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
311 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0490064  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
465 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
620 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48371  predicted protein  34.48 
 
 
222 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0522  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 
290 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.598532  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.73 
 
 
293 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 
4079 aa  42.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
828 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
274 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 
1121 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 
715 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.33 
 
 
267 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
699 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  30.86 
 
 
208 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.99 
 
 
790 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1193  hypothetical protein  25.71 
 
 
305 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.65343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
879 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
399 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
790 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32 
 
 
620 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
643 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.88 
 
 
622 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 
638 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 
828 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
586 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 
833 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 
264 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.83 
 
 
841 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
486 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.34 
 
 
622 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  32.47 
 
 
658 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.26 
 
 
441 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 
441 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 
685 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
362 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
615 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35995  predicted protein  30.51 
 
 
259 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 
714 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
1714 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
578 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
232 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 
808 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 
639 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
405 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
402 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 
263 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1753  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
366 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 
689 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  28.38 
 
 
864 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 
909 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 
681 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3751  tetratricopeptide TPR_2  29.58 
 
 
204 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87227  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0712  hypothetical protein  30.99 
 
 
161 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 
927 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1169  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  32.76 
 
 
619 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
207 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 
833 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 
828 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
955 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.2 
 
 
274 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3547  TPR repeat-containing protein  38.57 
 
 
306 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.631542  normal  0.0297483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>