38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3354 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3354  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 949 aa  1934    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129788  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  38.16 
 
 		 576 aa  56.2  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.38 
 
 		 810 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 4079 aa  53.9  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 792 aa  52  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 266 aa  49.3  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2790  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 119 aa  49.7  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185458 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 213 aa  49.3  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1463  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 329 aa  48.5  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951693  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 827 aa  48.5  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1125  TPR domain-containing protein  22.04 
 
 		 457 aa  47.8  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  32.39 
 
 		 269 aa  48.1  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 269 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 295 aa  47.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.71 
 
 		 746 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 273 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.84 
 
 		 769 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 279 aa  46.6  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 1121 aa  46.2  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  24.85 
 
 		 444 aa  46.2  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 632 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 291 aa  45.8  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 565 aa  45.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  29.31 
 
 		 699 aa  45.8  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.58 
 
 		 219 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4645  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 349 aa  45.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 301 aa  45.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 927 aa  45.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 878 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.89 
 
 		 1274 aa  45.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4194  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24 
 
 		 178 aa  45.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0720467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  30.34 
 
 		 198 aa  45.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.95 
 
 		 466 aa  44.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4208  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.45 
 
 		 1001 aa  44.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0104266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 1714 aa  44.7  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 254 aa  44.7  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0451  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.73 
 
 		 251 aa  44.7  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000076324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.03 
 
 		 988 aa  44.3  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>