39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4194 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4194  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 178 aa  365  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0720467  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2438  hypothetical protein  38.1 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0716881  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.67 
 
 		 736 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 523 aa  55.5  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.56 
 
 		 586 aa  55.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.48 
 
 		 836 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_1550  predicted protein  33.33 
 
 		 381 aa  50.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.058598  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 762 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 		 250 aa  48.9  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 123 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 123 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 792 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 716 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1957  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.11 
 
 		 375 aa  45.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3354  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 949 aa  45.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129788  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.48 
 
 		 1067 aa  44.7  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 452 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3132  tetratricopeptide repeat protein  25 
 
 		 1400 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0761546 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.66 
 
 		 927 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2761  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 468 aa  43.5  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.594013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.52 
 
 		 622 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2322  tetratricopeptide repeat protein  24.11 
 
 		 1400 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.6 
 
 		 2401 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3167  hypothetical protein  24.11 
 
 		 296 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 273 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1040  membrane protein  26.96 
 
 		 282 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.48 
 
 		 622 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 559 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  21.49 
 
 		 879 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 475 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 467 aa  42.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 450 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2240  hypothetical protein  25 
 
 		 1400 aa  42  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274881  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2185  tetratricopeptide repeat protein  24.11 
 
 		 1400 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 		 1297 aa  41.6  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1994  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1400 aa  41.6  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.42 
 
 		 1274 aa  41.6  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0851  hypothetical protein  25.38 
 
 		 544 aa  40.8  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  19.63 
 
 		 458 aa  40.8  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>