29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1040 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1040  membrane protein  100 
 
 		 282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06554  hypothetical protein  70.4 
 
 		 282 aa  408  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000673  TPR repeat containing protein  70.37 
 
 		 281 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0271673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3277  TPR repeat-containing protein  65.6 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.114437 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1114  TPR repeat-containing protein  65.6 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1081  TPR repeat-containing protein  65.6 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1012  TPR repeat-containing protein  70.12 
 
 		 308 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.47501  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0934  TPR repeat-containing protein  66.16 
 
 		 304 aa  367  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000927672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3334  TPR repeat-containing protein  41.8 
 
 		 297 aa  218  7.999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0522  TPR repeat-containing protein  40.08 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.598532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1193  hypothetical protein  42.86 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.65343 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0614  hypothetical protein  34.11 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 250 aa  52.4  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 123 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 123 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.96 
 
 		 736 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 927 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 		 836 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.51 
 
 		 738 aa  46.2  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  26.76 
 
 		 1240 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1852  protein of unknown function DUF86  28.92 
 
 		 208 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1878  protein of unknown function DUF86  28.92 
 
 		 208 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1138 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 523 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.66 
 
 		 1979 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 344 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4194  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.96 
 
 		 178 aa  43.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0720467  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  18.49 
 
 		 750 aa  42.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0681  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 375 aa  42.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>