134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3334 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3334  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
297 aa  610  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1193  hypothetical protein  49 
 
 
305 aa  264  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.65343 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0522  TPR repeat-containing protein  45.21 
 
 
290 aa  257  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.598532  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06554  hypothetical protein  45.31 
 
 
282 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000673  TPR repeat containing protein  44.67 
 
 
281 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0271673  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0934  TPR repeat-containing protein  45.08 
 
 
304 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000927672  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1081  TPR repeat-containing protein  40.77 
 
 
308 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1114  TPR repeat-containing protein  40.77 
 
 
308 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918708 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1012  TPR repeat-containing protein  44.67 
 
 
308 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.47501  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3277  TPR repeat-containing protein  44.67 
 
 
308 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.114437 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1040  membrane protein  41.8 
 
 
282 aa  218  7.999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0614  hypothetical protein  35.48 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
123 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
123 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 
699 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1878  protein of unknown function DUF86  37.97 
 
 
208 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1852  protein of unknown function DUF86  37.97 
 
 
208 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
927 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
716 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  34.44 
 
 
267 aa  56.6  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 
792 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.02 
 
 
352 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.46 
 
 
738 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.55 
 
 
296 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
602 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.48 
 
 
836 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 
4489 aa  52.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.45 
 
 
736 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.82 
 
 
237 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
250 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  29.52 
 
 
573 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
3560 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 
642 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2790  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 
119 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.185458 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 
687 aa  50.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 
718 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 
743 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 
523 aa  50.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1564  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 
199 aa  50.1  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
878 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 
810 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2395  tetratricopeptide TPR_2  28.48 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.91 
 
 
1694 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
3035 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 
4079 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.35 
 
 
572 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.97 
 
 
818 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4489  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
195 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1973  tetratricopeptide TPR_2  35.14 
 
 
507 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 
607 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.35 
 
 
572 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4354  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 
446 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
591 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
610 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.6 
 
 
757 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1770  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
173 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  28.42 
 
 
619 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.53 
 
 
610 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  29.49 
 
 
1007 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
574 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4146  tetratricopeptide TPR_2  32.14 
 
 
203 aa  46.6  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631366  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
1737 aa  46.2  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  32.89 
 
 
1979 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
388 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 
732 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  29.51 
 
 
577 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.81 
 
 
1056 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 
1192 aa  46.2  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3387  hypothetical protein  34.07 
 
 
215 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  30.7 
 
 
573 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.97 
 
 
784 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
388 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  32.89 
 
 
621 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  34.67 
 
 
425 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  30.16 
 
 
593 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  31.52 
 
 
572 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 
892 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 
566 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
1406 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  32.89 
 
 
621 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
762 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.74 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  24.65 
 
 
1138 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
486 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  23.38 
 
 
1014 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  33.33 
 
 
832 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  25.61 
 
 
1240 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 
452 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
562 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  25.61 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 
566 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  29.46 
 
 
583 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 
1276 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 
559 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  30.16 
 
 
592 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  29.27 
 
 
594 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
1297 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 
284 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 
1276 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>