108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4489 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4489  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
195 aa  400  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
212 aa  59.3  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
878 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.22 
 
 
798 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 
209 aa  53.9  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  33.61 
 
 
208 aa  53.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
780 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.72 
 
 
572 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.2 
 
 
810 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.86 
 
 
410 aa  52.4  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  40 
 
 
622 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.81 
 
 
622 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
315 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.4 
 
 
2240 aa  49.7  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
288 aa  48.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.15 
 
 
572 aa  48.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3334  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
297 aa  48.1  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  29.03 
 
 
566 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
824 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  36.92 
 
 
622 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0082  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.09 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.146117  hitchhiker  0.00321946 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  21.62 
 
 
3145 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.33 
 
 
725 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  41.94 
 
 
534 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1223  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.23 
 
 
273 aa  47  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.33 
 
 
764 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 
750 aa  45.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.33 
 
 
769 aa  45.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 
452 aa  45.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  25.93 
 
 
594 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
323 aa  45.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 
927 aa  45.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 
637 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  23.68 
 
 
626 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0811  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.22 
 
 
236 aa  45.1  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.940424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.43 
 
 
1486 aa  45.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1537  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 
296 aa  45.4  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.14244  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
448 aa  45.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
567 aa  45.1  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
233 aa  45.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.57 
 
 
267 aa  45.1  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  22.97 
 
 
820 aa  44.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.75 
 
 
865 aa  44.7  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1601  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.54 
 
 
355 aa  45.1  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.799203  unclonable  3.52104e-23 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  23.2 
 
 
1014 aa  44.7  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
636 aa  44.7  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.65 
 
 
632 aa  44.7  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 
635 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 
635 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
2262 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
2262 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 
611 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.45 
 
 
1056 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
612 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.27 
 
 
576 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.64 
 
 
784 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2117  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.18 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.68 
 
 
784 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.17 
 
 
988 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23400  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000457247  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 
573 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  24.83 
 
 
550 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  29 
 
 
767 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
1737 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0116  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.266905 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  27.78 
 
 
779 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
792 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 
639 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.74 
 
 
561 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.84 
 
 
291 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
1056 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
886 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  26.4 
 
 
437 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.74 
 
 
561 aa  42.7  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4242  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 
219 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 
723 aa  42.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 
523 aa  43.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.05 
 
 
818 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.67 
 
 
293 aa  42.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  28.72 
 
 
575 aa  42.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0681  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
375 aa  42.4  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.72 
 
 
1022 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
465 aa  42.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3167  hypothetical protein  25 
 
 
296 aa  42  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3772  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
208 aa  42  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31677  predicted protein  33.96 
 
 
211 aa  42.4  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625789  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0311  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 
513 aa  42  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0753033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2668  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 
206 aa  42  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
833 aa  42  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.83 
 
 
668 aa  42.4  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  27.21 
 
 
266 aa  42  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11133  TPR repeat protein  28.7 
 
 
417 aa  42  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.474145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 
699 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 
878 aa  41.6  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 
559 aa  41.6  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.17 
 
 
689 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 
3172 aa  41.6  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  38.46 
 
 
614 aa  41.2  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3107  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
219 aa  41.2  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>