64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3277 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3277  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 308 aa  633    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.114437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1012  TPR repeat-containing protein  99.35 
 
 		 308 aa  628  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.47501  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1114  TPR repeat-containing protein  99.35 
 
 		 308 aa  628  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1081  TPR repeat-containing protein  99.03 
 
 		 308 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0934  TPR repeat-containing protein  80 
 
 		 304 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000927672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1040  membrane protein  65.6 
 
 		 282 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06554  hypothetical protein  63.93 
 
 		 282 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000673  TPR repeat containing protein  63.21 
 
 		 281 aa  360  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0271673  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3334  TPR repeat-containing protein  44.67 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0522  TPR repeat-containing protein  42.62 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.598532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1193  hypothetical protein  36.63 
 
 		 305 aa  202  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.65343 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0614  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  85.9  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 927 aa  59.3  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 123 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 123 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1852  protein of unknown function DUF86  25.61 
 
 		 208 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1878  protein of unknown function DUF86  25.61 
 
 		 208 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.87 
 
 		 1056 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.24 
 
 		 736 aa  52.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 250 aa  52.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 4079 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  30.99 
 
 		 1138 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  29.91 
 
 		 573 aa  50.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.86 
 
 		 836 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.12 
 
 		 1979 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 662 aa  46.6  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 602 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.07 
 
 		 1022 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.26 
 
 		 738 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 3560 aa  46.2  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00531  hypothetical protein  31 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.55 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  25 
 
 		 539 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  34.33 
 
 		 442 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 392 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1499  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00502134  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1288  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.130508  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.59 
 
 		 818 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.98 
 
 		 784 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1564  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0681  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 617 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 4489 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.49 
 
 		 286 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 344 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.7 
 
 		 750 aa  43.9  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.82 
 
 		 1838 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 687 aa  43.5  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.42 
 
 		 988 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 291 aa  43.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00551  hypothetical protein  31.33 
 
 		 248 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.276796  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  26.32 
 
 		 706 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 		 543 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.22 
 
 		 622 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 716 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 391 aa  42.7  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  31.11 
 
 		 417 aa  42.7  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  25.25 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  28.24 
 
 		 745 aa  42.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.49 
 
 		 286 aa  42.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_002950  PG2200  TPR domain-containing protein  27.78 
 
 		 695 aa  42.4  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  25.93 
 
 		 398 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>