43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000673 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000673  TPR repeat containing protein  100 
 
 		 281 aa  569  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0271673  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06554  hypothetical protein  90.94 
 
 		 282 aa  517  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1040  membrane protein  70.37 
 
 		 282 aa  393  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3277  TPR repeat-containing protein  63.21 
 
 		 308 aa  360  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.114437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1012  TPR repeat-containing protein  62.86 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.47501  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1114  TPR repeat-containing protein  62.86 
 
 		 308 aa  358  4e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1081  TPR repeat-containing protein  62.86 
 
 		 308 aa  358  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0934  TPR repeat-containing protein  67.59 
 
 		 304 aa  358  6e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000927672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3334  TPR repeat-containing protein  44.67 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0522  TPR repeat-containing protein  39.75 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.598532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1193  hypothetical protein  41.88 
 
 		 305 aa  195  9e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.65343 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0614  hypothetical protein  32.59 
 
 		 151 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 927 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 750 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 123 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 123 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  29.91 
 
 		 573 aa  51.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.12 
 
 		 736 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00531  hypothetical protein  39.47 
 
 		 250 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 344 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  26.26 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.15 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.5 
 
 		 1979 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 687 aa  45.8  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.03 
 
 		 738 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 547 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 543 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 523 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  30.59 
 
 		 417 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00551  hypothetical protein  31.03 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.276796  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0309  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 116 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.143166  normal  0.277708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 699 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0681  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1138 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  29.41 
 
 		 442 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1878  protein of unknown function DUF86  26.92 
 
 		 208 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1852  protein of unknown function DUF86  26.92 
 
 		 208 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 391 aa  42.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 617 aa  42.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 3560 aa  42  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>