263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1249 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1249  integrase family protein  100 
 
 		 388 aa  794    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.447999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  40.97 
 
 		 391 aa  300  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1378  integrase family protein  27.25 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.545263  hitchhiker  0.00000000645491 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4353  integrase family protein  29.34 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  22.7 
 
 		 325 aa  67  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  26.42 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  26.4 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  22.27 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  25.95 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4380  integrase family protein  25.87 
 
 		 470 aa  62.8  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  25.55 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  22.16 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  27.42 
 
 		 329 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  25.81 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  25.81 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  24.91 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  24.06 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  23.55 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24.63 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  26.14 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  26.4 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  28.9 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  20.31 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  26.07 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  25.99 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  26.54 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  26.82 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2865  site-specific recombinase XerD-like  28.57 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.11888  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  25.37 
 
 		 687 aa  57.4  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  26.9 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3077  integrase family protein  25.22 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.486947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  26.74 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  25.74 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  25.13 
 
 		 477 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  29.38 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  27.03 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0616  integrase family protein  22.56 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  27.87 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  30.81 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  26.14 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0676  integrase family protein  22.34 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0526  phage integrase family protein  25.45 
 
 		 189 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0707528  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4388  integrase family protein  26.71 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.754595  normal  0.599822 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  21.08 
 
 		 392 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  22.98 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  29.73 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  27.98 
 
 		 307 aa  55.5  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  29.73 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  25.38 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  22.1 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  21.19 
 
 		 354 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  21.49 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  21.19 
 
 		 354 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  25.22 
 
 		 362 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  21.8 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  22.64 
 
 		 386 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  26.14 
 
 		 349 aa  53.5  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  27.13 
 
 		 373 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  25.87 
 
 		 346 aa  53.5  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3617  phage integrase family protein  24.88 
 
 		 305 aa  53.1  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2427  phage integrase family protein  27.88 
 
 		 414 aa  52.8  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3671  phage integrase family protein  25.62 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3642  phage integrase family protein  25.62 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000185721  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  20.62 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  26.9 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  22.76 
 
 		 334 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  22.35 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  21.4 
 
 		 439 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  22.28 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  24.23 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  23.97 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  26.97 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  27.59 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  22.84 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  22.33 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  22.52 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  23.11 
 
 		 291 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  21.55 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  22.19 
 
 		 369 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  21.69 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  25.84 
 
 		 404 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  27.59 
 
 		 348 aa  51.6  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4174  integrase family protein  28.89 
 
 		 480 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2283  phage integrase family protein  22.59 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  22.19 
 
 		 369 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  22.19 
 
 		 369 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  22.19 
 
 		 369 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  25.51 
 
 		 407 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  27.71 
 
 		 338 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  22.77 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  22.28 
 
 		 295 aa  50.4  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  22.61 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  23.38 
 
 		 385 aa  50.4  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  22.49 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  24.68 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  24.68 
 
 		 401 aa  50.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  21.9 
 
 		 419 aa  50.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  24.5 
 
 		 369 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>