More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4098 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4098  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 410 aa  838    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5189  secretion protein HlyD family protein  69.27 
 
 		 409 aa  594  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.367271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2925  hypothetical protein  58.75 
 
 		 410 aa  501  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0831284  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1989  hypothetical protein  53.17 
 
 		 410 aa  448  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4174  hypothetical protein  47.22 
 
 		 413 aa  415  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0618  secretion protein HlyD family protein  29.38 
 
 		 396 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1965  putative membrane fusion protein family member  29.14 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.686459  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4040  secretion protein HlyD family protein  28.53 
 
 		 385 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  24.24 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  24.73 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  24.18 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  24.18 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  24.18 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  24.18 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  24.18 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  24.19 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  24.19 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  24.18 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  24.19 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4095  membrane fusion protein family protein  24.19 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  24.12 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  24.19 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  24.19 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  24.19 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.954749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  24.19 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4014  auxiliary transport protein, membrane fusion protein family  25.79 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  24.18 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  30.22 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3252  secretion protein HlyD family protein  25.15 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  29.78 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  29.37 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  26.23 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0115  secretion protein HlyD family protein  22.83 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  28.83 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  28.83 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3016  secretion protein HlyD family protein  23.8 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  25.89 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  25.75 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1024  secretion protein HlyD family protein  25.38 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.524783  normal  0.0152153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0873  secretion protein HlyD family protein  25.15 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3096  secretion protein HlyD family protein  23.8 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3693  secretion protein HlyD family protein  23.64 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  26.47 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0975  secretion protein HlyD family protein  25.8 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000270967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  27.83 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  27.76 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2805  HlyD family secretion protein  24.76 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.743395 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  30.49 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  26.81 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  29.08 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  26.38 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  26.38 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  25.32 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  26.38 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  26.38 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  26.38 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  26.38 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3603  HlyD family secretion protein  24.05 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3193  secretion protein HlyD family protein  25.08 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.252667 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  32.04 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  25.25 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  28.23 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  25.53 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  28.22 
 
 		 348 aa  62.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  25.75 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  27.35 
 
 		 351 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  25.45 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  26.92 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20620  HlyD family secretion protein  25.68 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0045141  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0185  putative multidrug resistance efflux pump  26.7 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  27.04 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  26.7 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  26.49 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  27.59 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  28.5 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  30.1 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0234  secretion protein HlyD family protein  29.69 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  24.18 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1770  putative secretion protein  24.86 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  26.2 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  29.81 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  26.95 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  26.72 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2518  secretion protein HlyD  24.25 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.554546  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  27.8 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  29.59 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0008  secretion protein HlyD family protein  24.75 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000302217  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  26.38 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  24.58 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  27.8 
 
 		 467 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  28.27 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4510  multidrug resistance protein MdtN  27.23 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803564  normal  0.0531786 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  26.58 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  24.62 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  26.91 
 
 		 355 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3414  RND family efflux transporter MFP subunit  25.16 
 
 		 313 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.100509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  28.57 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  25.74 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3251  secretion protein HlyD family protein  23.43 
 
 		 356 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  26.67 
 
 		 344 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>