202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4174 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4174  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  855    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5189  secretion protein HlyD family protein  49.15 
 
 		 409 aa  415  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.367271 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4098  secretion protein HlyD family protein  47.22 
 
 		 410 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1989  hypothetical protein  47.22 
 
 		 410 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2925  hypothetical protein  46.4 
 
 		 410 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0831284  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0618  secretion protein HlyD family protein  31.11 
 
 		 396 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1965  putative membrane fusion protein family member  30.37 
 
 		 396 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.686459  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0975  secretion protein HlyD family protein  25.53 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000270967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3016  secretion protein HlyD family protein  23.77 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1024  secretion protein HlyD family protein  25.35 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.524783  normal  0.0152153 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3096  secretion protein HlyD family protein  23.77 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3298  secretion protein HlyD family protein  24.22 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1094  secretion protein HlyD family protein  24.22 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1061  secretion protein HlyD family protein  24.22 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0991  secretion protein HlyD family protein  24.22 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3603  HlyD family secretion protein  23.26 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  22.4 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3029  hypothetical protein  24.67 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757127  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4040  secretion protein HlyD family protein  26.09 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  27.09 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3193  secretion protein HlyD family protein  23.26 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.252667 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4014  auxiliary transport protein, membrane fusion protein family  22.26 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2805  HlyD family secretion protein  28.04 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.743395 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  22.26 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  22.26 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  22.26 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  22.26 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  22.26 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4095  membrane fusion protein family protein  22.26 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  22.26 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.954749 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  22.26 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0873  secretion protein HlyD family protein  24.4 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  28.06 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  22.85 
 
 		 378 aa  67  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0890  secretion protein HlyD family protein  25.08 
 
 		 378 aa  67  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  22.6 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  22.26 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  22.26 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  22.26 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  22.26 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  24.76 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  21.92 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  21.92 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  22.26 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0115  secretion protein HlyD family protein  20.89 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  21.92 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  21.5 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  24.48 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  25.73 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  25.24 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  25.24 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  25.24 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  26.21 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  24.76 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  26.21 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  27.6 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  24.76 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  24.76 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  24.76 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2816  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  25.21 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106074  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4314  MFS efflux pump, membrane fusion protein, EmrA subfamily  24.79 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  22.73 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  26.09 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  25.58 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  22.27 
 
 		 405 aa  53.5  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  25.24 
 
 		 404 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  25.24 
 
 		 404 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  25.24 
 
 		 404 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  21.94 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0310  hypothetical protein  23.3 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  23.29 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  21.07 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01156  multidrug resistance efflux pump  24.24 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1000  multidrug resistance efflux pump  26.29 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  24.54 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  20.7 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  22.83 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0327  hypothetical protein  22.82 
 
 		 330 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  25.37 
 
 		 381 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1203  secretion protein HlyD family protein  28.78 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0133764  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  21.8 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  27.33 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  24.9 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  24.76 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  24.64 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  24.76 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  26.12 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  26.21 
 
 		 420 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  25.89 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  26.09 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  28.48 
 
 		 373 aa  50.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1636  efflux pump membrane protein  24.38 
 
 		 424 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00067211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  21.53 
 
 		 355 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  26.18 
 
 		 342 aa  50.4  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  32.54 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  23.83 
 
 		 392 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3693  secretion protein HlyD family protein  22.3 
 
 		 378 aa  50.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  25.35 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3930  multidrug resistance protein A  24.63 
 
 		 394 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.725166 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06917  hypothetical protein  24.04 
 
 		 356 aa  50.1  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>