More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0847 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  100 
 
 
473 aa  968    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  54.55 
 
 
471 aa  523  1e-147  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  43.58 
 
 
468 aa  402  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  44.52 
 
 
467 aa  396  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  43.58 
 
 
472 aa  387  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  44.09 
 
 
468 aa  384  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  41.79 
 
 
465 aa  377  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  39.92 
 
 
469 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  40.17 
 
 
470 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  40.67 
 
 
468 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  40.76 
 
 
468 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  40.97 
 
 
468 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  40.76 
 
 
468 aa  352  7e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  40.76 
 
 
468 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  40.76 
 
 
468 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  40.64 
 
 
468 aa  349  5e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  40.13 
 
 
468 aa  348  8e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  38.43 
 
 
469 aa  344  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  38.43 
 
 
469 aa  344  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  40.25 
 
 
467 aa  343  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  38.19 
 
 
469 aa  339  5e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  35.88 
 
 
476 aa  324  2e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  37.76 
 
 
470 aa  301  2e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  33.98 
 
 
467 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  32.69 
 
 
465 aa  263  6e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.71 
 
 
345 aa  259  6e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  32.48 
 
 
465 aa  256  6e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  34.11 
 
 
464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  33.84 
 
 
464 aa  252  8.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  35.08 
 
 
464 aa  250  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  32.84 
 
 
465 aa  240  4e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  32.35 
 
 
463 aa  231  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  31.52 
 
 
473 aa  213  7.999999999999999e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  32.03 
 
 
444 aa  209  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  31.47 
 
 
449 aa  193  5e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  32.63 
 
 
481 aa  193  6e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  27.8 
 
 
438 aa  188  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  30.06 
 
 
481 aa  184  4.0000000000000006e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  27.67 
 
 
504 aa  156  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  26.95 
 
 
576 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  27.78 
 
 
450 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  27.02 
 
 
484 aa  152  8.999999999999999e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  27.37 
 
 
576 aa  150  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  26.54 
 
 
575 aa  146  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  27.5 
 
 
534 aa  147  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  25.36 
 
 
579 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.95 
 
 
457 aa  144  5e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  25.25 
 
 
592 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  25.99 
 
 
579 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  26.54 
 
 
525 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  26.88 
 
 
576 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  26.37 
 
 
576 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  28.57 
 
 
578 aa  134  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  25.49 
 
 
576 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  25.49 
 
 
585 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  24.72 
 
 
579 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  25.05 
 
 
508 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  24.57 
 
 
579 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  25.79 
 
 
456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  25.41 
 
 
533 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  24.36 
 
 
591 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  27.38 
 
 
533 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  25.61 
 
 
533 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  24.36 
 
 
547 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  24.08 
 
 
547 aa  103  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  24.08 
 
 
547 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4599  Xaa-His dipeptidase, C-terminus  52.38 
 
 
108 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  23.53 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  24.6 
 
 
280 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  23.24 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.017723 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.79 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  22.68 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  34.62 
 
 
512 aa  68.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.54 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2652  M20/DapE family protein YgeY  28.95 
 
 
443 aa  65.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  41.46 
 
 
407 aa  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3197  peptidase  29.22 
 
 
403 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0240  peptidase  29.03 
 
 
460 aa  63.9  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000787577  normal  0.24947 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02705  hypothetical protein  28.57 
 
 
403 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0820  M20/DapE family protein YgeY  28.57 
 
 
403 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3032  peptidase  28.57 
 
 
403 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3005  peptidase  28.57 
 
 
403 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0836  peptidase  28.57 
 
 
403 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4162  peptidase  28.57 
 
 
403 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  35.4 
 
 
421 aa  63.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02667  hypothetical protein  28.03 
 
 
402 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  31.1 
 
 
385 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  31.71 
 
 
385 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.37 
 
 
410 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.63 
 
 
395 aa  63.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.61 
 
 
396 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.79 
 
 
366 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1663  M20/DapE family protein YgeY  27.92 
 
 
436 aa  62.4  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3480  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.19 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0078  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.23 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1445  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.59 
 
 
365 aa  61.6  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0181667  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.75 
 
 
363 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  32.03 
 
 
455 aa  60.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  28.1 
 
 
415 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  32.54 
 
 
411 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>