More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2800 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  60.85 
 
 		 206 aa  218  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  60.64 
 
 		 206 aa  215  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  54.77 
 
 		 219 aa  211  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  55.9 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  55.9 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  55.9 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  55.61 
 
 		 235 aa  208  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 295 aa  206  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  54.69 
 
 		 208 aa  203  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  55.61 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  44.86 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  42.94 
 
 		 223 aa  125  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 199 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 237 aa  124  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 213 aa  121  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0321  TetR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 223 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4586  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.330892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  44.55 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3500  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.242129  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0313  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3330  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537262 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3774  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3995  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3442  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.747618  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  25.42 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  37.93 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  28.68 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3509  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  31.36 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  48.89 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  46.94 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  28.95 
 
 		 222 aa  49.3  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4837  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 237 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4925  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 237 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  43.14 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  32.58 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  32.58 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  32.58 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4579  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  32.58 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  32.58 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  32.58 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0323  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939407  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4584  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0016  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03806  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  33.77 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 247 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>