More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0647 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0647  D-amino-acid dehydrogenase  100 
 
 		 452 aa  902    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685795  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1818  D-amino-acid dehydrogenase  59.03 
 
 		 419 aa  461  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3470  D-amino-acid dehydrogenase  52.94 
 
 		 458 aa  428  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0955  D-amino-acid dehydrogenase  52.66 
 
 		 416 aa  413  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.249989 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  49.07 
 
 		 419 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1087  FAD dependent oxidoreductase  52.17 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  51.29 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1275  FAD dependent oxidoreductase  52.01 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189046  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2431  D-amino-acid dehydrogenase  48.71 
 
 		 416 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  47.79 
 
 		 415 aa  364  1e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0827  D-amino-acid dehydrogenase  50.61 
 
 		 419 aa  349  5e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.365024  normal  0.0750347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3596  FAD dependent oxidoreductase  48.71 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5323  D-amino-acid dehydrogenase  47.33 
 
 		 417 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.161486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5235  D-amino-acid dehydrogenase  47.33 
 
 		 417 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288943  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5615  D-amino-acid dehydrogenase  47.33 
 
 		 417 aa  336  7e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.925695 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4780  D-amino-acid dehydrogenase  47.2 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0198  FAD dependent oxidoreductase  42.49 
 
 		 408 aa  275  9e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.777626  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  27.86 
 
 		 462 aa  176  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 441 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 440 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  29.26 
 
 		 416 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.47 
 
 		 428 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 415 aa  149  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 420 aa  144  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  28.6 
 
 		 415 aa  133  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  28.05 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 437 aa  126  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0313  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.14 
 
 		 421 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 425 aa  124  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.56 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 413 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 418 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.17 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  29.18 
 
 		 435 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.9 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1981  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.24 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200719  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2000  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.95 
 
 		 435 aa  117  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.881788  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6079  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.18 
 
 		 421 aa  117  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.88 
 
 		 434 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.88 
 
 		 434 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 415 aa  116  8.999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.37 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.385338  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  26.44 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.65 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1346  D-amino acid oxidase  26.37 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0584052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26 
 
 		 433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.88 
 
 		 433 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0700  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.6 
 
 		 425 aa  113  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.17 
 
 		 418 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0886  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204512 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0673  D-amino-acid dehydrogenase  24.76 
 
 		 417 aa  111  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180164  hitchhiker  0.00553067 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.76 
 
 		 416 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0369  D-amino-acid dehydrogenase  26.34 
 
 		 421 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 411 aa  110  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 416 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 416 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.77 
 
 		 419 aa  109  8.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0385  D-amino-acid dehydrogenase  26.24 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  25.66 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4708  D-amino-acid dehydrogenase  28.16 
 
 		 416 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2701  D-amino-acid dehydrogenase  25.85 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0406  D-amino-acid dehydrogenase  25.85 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696057  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  25.7 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.88 
 
 		 432 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  27.97 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  26.49 
 
 		 419 aa  108  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  25.59 
 
 		 416 aa  107  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 416 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 417 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  27.36 
 
 		 421 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0558  D-amino-acid dehydrogenase small subunit  24.7 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  25.49 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1385  D-amino-acid dehydrogenase  25.6 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.71736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2005  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.35 
 
 		 416 aa  106  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143364  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.98 
 
 		 416 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  26.09 
 
 		 422 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.06 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3113  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.62 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2093  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.95 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59754  normal  0.0350619 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.02 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3504  D-amino-acid dehydrogenase  26.73 
 
 		 438 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1503  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.12 
 
 		 425 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.839298  normal  0.265321 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03073  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.18 
 
 		 428 aa  104  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>