79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4434 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  100 
 
 		 393 aa  763    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  73.89 
 
 		 395 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  52.7 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  48.92 
 
 		 400 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  48.92 
 
 		 397 aa  292  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 		 426 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  43.64 
 
 		 391 aa  234  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  40.61 
 
 		 399 aa  229  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 		 404 aa  223  6e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  42.98 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 387 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  43.66 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  44.51 
 
 		 387 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 389 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  44.48 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 402 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 397 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  38.72 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 399 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 369 aa  143  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 399 aa  140  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  33.51 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 408 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  33.62 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  30.03 
 
 		 414 aa  123  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 400 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  31.56 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 425 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  33.23 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  34.25 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 401 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 408 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  31.07 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 433 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  27.89 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 405 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  27.98 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  29.45 
 
 		 216 aa  53.1  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 424 aa  49.7  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.08 
 
 		 615 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4068  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 409 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  29.11 
 
 		 429 aa  43.9  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  29.11 
 
 		 430 aa  43.5  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 421 aa  43.1  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 428 aa  43.1  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  28.76 
 
 		 399 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>