More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2939 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2939  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 360 aa  692    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0355871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3550  putative transcriptional regulator, TetR family  62.25 
 
 		 374 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0101342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2117  transcriptional regulator, TetR family  47.71 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 226 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 188 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  45 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  38.78 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 204 aa  57  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  45.59 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1196  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 235 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270816  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 203 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 203 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 203 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 222 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 225 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  37.76 
 
 		 213 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 207 aa  53.9  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 209 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 269 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 209 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  25.93 
 
 		 198 aa  53.5  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 204 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 206 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 206 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 206 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  40.32 
 
 		 254 aa  52.8  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 209 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 193 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 203 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 219 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 202 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 209 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 212 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  30.77 
 
 		 206 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 208 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 198 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2423  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 218 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 216 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 221 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 233 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4876  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 208 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 206 aa  51.2  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 187 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  38.6 
 
 		 213 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 193 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 230 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 202 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 206 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 175 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 202 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 197 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 202 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 228 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 233 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 205 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 197 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 215 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 215 aa  50.8  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 206 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 205 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 192 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 206 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  50.4  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 221 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 217 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 211 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 206 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 206 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 198 aa  50.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 216 aa  49.7  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 238 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 247 aa  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 220 aa  49.7  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 227 aa  49.7  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 227 aa  49.7  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 217 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 217 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  41.94 
 
 		 198 aa  49.3  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 204 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  46.88 
 
 		 219 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 186 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 212 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 221 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 206 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 205 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 191 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 186 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 186 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>