107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1632 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  100 
 
 		 207 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  48.29 
 
 		 204 aa  151  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10310  transcriptional regulator, tetR family  36.65 
 
 		 230 aa  88.2  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 266 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3670  hypothetical protein  30.56 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3471  hypothetical protein  30.56 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  26.73 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3366  regulatory protein, TetR  28.17 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.402677  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3344  hypothetical protein  29.86 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  27.31 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  25.78 
 
 		 268 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 304 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  29.45 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 255 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 272 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 263 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 258 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 253 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 245 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 231 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 240 aa  48.5  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  25.12 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6425  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857124 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 257 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 271 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  26.24 
 
 		 260 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  32.35 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  24.64 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 259 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 173 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4446  hypothetical protein  24.85 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.25718 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0559  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0585  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  25.89 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  22.34 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  24.67 
 
 		 263 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3750  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 289 aa  42.4  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 267 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  27.66 
 
 		 248 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>