299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2762 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3123  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  71.57 
 
 		 615 aa  822    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11522  methylmalonyl-CoA mutase small subunit mutA  67.66 
 
 		 623 aa  754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384078 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3184  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  71.57 
 
 		 615 aa  822    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2762  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  100 
 
 		 626 aa  1221    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3134  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  71.25 
 
 		 615 aa  820    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3650  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  79.01 
 
 		 620 aa  909    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2419  Methylmalonyl-CoA mutase  51.65 
 
 		 652 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.751014  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2104  Methylmalonyl-CoA mutase  46.53 
 
 		 597 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2506  Methylmalonyl-CoA mutase  46.1 
 
 		 614 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000082079  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2761  methylmalonyl-CoA mutase  45.76 
 
 		 630 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257221  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5544  Methylmalonyl-CoA mutase  45.59 
 
 		 644 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3006  methylmalonyl-CoA mutase  43.51 
 
 		 660 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.84067  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6419  Methylmalonyl-CoA mutase  44.35 
 
 		 593 aa  375  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1943  methylmalonyl-CoA mutase  44.82 
 
 		 653 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3187  Methylmalonyl-CoA mutase  41.03 
 
 		 633 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800977  normal  0.217414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4374  Methylmalonyl-CoA mutase  43.87 
 
 		 640 aa  359  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05670  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  46.14 
 
 		 622 aa  353  4e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1921  methylmalonyl-CoA mutase  42.72 
 
 		 601 aa  329  7e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00796016  normal  0.671948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  35.67 
 
 		 698 aa  302  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2636  methylmalonyl-CoA mutase  38.93 
 
 		 629 aa  277  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668897  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5425  methylmalonyl-CoA mutase  39.8 
 
 		 612 aa  273  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3023  methylmalonyl-CoA mutase small subunit (MCM-beta)  37.3 
 
 		 621 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0217  methylmalonyl-CoA mutase  39.06 
 
 		 611 aa  264  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3135  methylmalonyl-CoA mutase  38.42 
 
 		 629 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2236  methylmalonyl-CoA mutase  36.04 
 
 		 639 aa  252  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.02 
 
 		 682 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.61 
 
 		 681 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1762  methylmalonyl-CoA mutase  36.29 
 
 		 621 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2665  Methylmalonyl-CoA mutase  38.69 
 
 		 605 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2388  methylmalonyl-CoA mutase  38.83 
 
 		 605 aa  242  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.55342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1929  methylmalonyl-CoA mutase  34.98 
 
 		 623 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2345  Methylmalonyl-CoA mutase  36.94 
 
 		 605 aa  233  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2041  Methylmalonyl-CoA mutase  34.27 
 
 		 623 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  36.18 
 
 		 713 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22180  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  33.83 
 
 		 710 aa  225  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0921601  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5167  Methylmalonyl-CoA mutase  40.28 
 
 		 600 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3545  methylmalonyl-CoA mutase  38.15 
 
 		 569 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1656  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  30.73 
 
 		 618 aa  216  7e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3536  methylmalonyl-CoA mutase  34.88 
 
 		 623 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0287465  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3785  Methylmalonyl-CoA mutase  34.96 
 
 		 621 aa  206  7e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.546238 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  34.31 
 
 		 684 aa  205  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  36.36 
 
 		 723 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.09 
 
 		 720 aa  196  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2200  methylmalonyl-CoA mutase  33.28 
 
 		 624 aa  187  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.53913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4729  methylmalonyl-CoA mutase  35.44 
 
 		 610 aa  182  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  36.6 
 
 		 706 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3629  methylmalonyl-CoA mutase  37 
 
 		 489 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1285  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.29 
 
 		 727 aa  166  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.238431  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1120  methylmalonyl-CoA mutase  41.08 
 
 		 480 aa  163  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.170859 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0857  methylmalonyl-CoA mutase  35.5 
 
 		 479 aa  162  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315986  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  31.88 
 
 		 722 aa  158  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1291  methylmalonyl-CoA mutase  30.06 
 
 		 588 aa  155  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.788589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  30.55 
 
 		 738 aa  155  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4326  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.61 
 
 		 563 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  31.44 
 
 		 714 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  30.41 
 
 		 722 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  31.06 
 
 		 709 aa  153  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  31.26 
 
 		 714 aa  153  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  30.85 
 
 		 709 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  31.01 
 
 		 714 aa  151  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  29.81 
 
 		 720 aa  151  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  31.43 
 
 		 712 aa  150  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0214  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.23 
 
 		 557 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  30.65 
 
 		 709 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  30.29 
 
 		 714 aa  150  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4237  methylmalonyl-CoA mutase  30.59 
 
 		 712 aa  150  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  29.49 
 
 		 716 aa  150  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  29.59 
 
 		 720 aa  150  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  29.91 
 
 		 714 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  29.85 
 
 		 723 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  29.65 
 
 		 721 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  29.91 
 
 		 714 aa  148  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  29.91 
 
 		 714 aa  148  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  29.91 
 
 		 714 aa  148  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  31.39 
 
 		 740 aa  148  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  29.91 
 
 		 714 aa  148  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.91 
 
 		 714 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  29.67 
 
 		 719 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  29.91 
 
 		 714 aa  148  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  30.11 
 
 		 718 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1349  methylmalonyl-CoA mutase  31.39 
 
 		 733 aa  147  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148615  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  29.7 
 
 		 714 aa  147  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5687  methylmalonyl-CoA mutase  30.85 
 
 		 712 aa  147  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0932  methylmalonyl-CoA mutase  31.33 
 
 		 724 aa  146  9e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1165  methylmalonyl-CoA mutase  30.55 
 
 		 589 aa  146  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.26 
 
 		 1106 aa  146  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3304  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.72 
 
 		 719 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00679496  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  30.21 
 
 		 712 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  29.07 
 
 		 731 aa  145  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  29.67 
 
 		 719 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  30.94 
 
 		 718 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  30.1 
 
 		 715 aa  145  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5545  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.14 
 
 		 738 aa  144  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.16 
 
 		 713 aa  143  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1292  methylmalonyl-CoA mutase  35.88 
 
 		 714 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0079  methylmalonyl-CoA mutase  28.6 
 
 		 706 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.373309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3367  methylmalonyl-CoA mutase  29.29 
 
 		 709 aa  143  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0910  methylmalonyl-CoA mutase  31.1 
 
 		 739 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.736612  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1168  Methylmalonyl-CoA mutase  26.01 
 
 		 591 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.648096  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3872  methylmalonyl-CoA mutase  31.15 
 
 		 740 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231489  normal  0.125312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>