More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1213 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  100 
 
 		 221 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  76.92 
 
 		 221 aa  363  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  76.82 
 
 		 221 aa  358  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  74.43 
 
 		 222 aa  345  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  74.43 
 
 		 222 aa  345  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  73.97 
 
 		 222 aa  342  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  54.23 
 
 		 223 aa  215  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  49.33 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  46.82 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  53.27 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  42.73 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  42.66 
 
 		 235 aa  177  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  41 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  41.28 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  47.24 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  41.12 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  40.09 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  39.3 
 
 		 219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  38.43 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  37.1 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  39.73 
 
 		 242 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  39.29 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  43.05 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  39.5 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  37.9 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  38.31 
 
 		 219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  39.2 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  37.44 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  38.81 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  37.44 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  39.91 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  37.95 
 
 		 231 aa  142  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  35.94 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  36.49 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  36.92 
 
 		 240 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  41.26 
 
 		 242 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  41.7 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  36.68 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  35.59 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  40.81 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  40.81 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  35.91 
 
 		 249 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  38 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  34.23 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  34.88 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  35.75 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  34.52 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  41.71 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  36.28 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  36.36 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  35.94 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  31.56 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  38.38 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  34.36 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  35.78 
 
 		 228 aa  121  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  34.93 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  31.39 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  35.86 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  37.02 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  34.5 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  33.79 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  32.57 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  31.53 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  34.26 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  39.55 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  35.29 
 
 		 225 aa  101  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  30.41 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  30.7 
 
 		 238 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  31.08 
 
 		 244 aa  99  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  36.96 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  31.19 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  36.96 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  37.68 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  36.23 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  30.91 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  29.6 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  34.65 
 
 		 232 aa  91.7  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  34.39 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  29.35 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  31.43 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  28.77 
 
 		 270 aa  87.8  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  29.41 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  28.51 
 
 		 241 aa  85.1  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  28.5 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  28.71 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  24.89 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  24.17 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  27 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  51.92 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  26.67 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.09 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  58 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  23.74 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  58 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  25.12 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  29.79 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  58 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  30.22 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  39.02 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  28.91 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>