89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1009 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1009  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 
802 aa  1583    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.28 
 
 
1063 aa  212  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.38 
 
 
1949 aa  170  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44.97 
 
 
1067 aa  147  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.44 
 
 
1056 aa  146  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1718  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.83 
 
 
777 aa  140  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  33.83 
 
 
666 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0847  putative outer membrane adhesin like protein  43.48 
 
 
567 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189392  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  35.79 
 
 
3927 aa  127  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  36.84 
 
 
2377 aa  124  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1752  hypothetical protein  31.36 
 
 
465 aa  124  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000233386  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5004  hypothetical protein  41.09 
 
 
1039 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  28.95 
 
 
1597 aa  108  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  29.34 
 
 
389 aa  105  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.91 
 
 
1884 aa  102  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  36.39 
 
 
1867 aa  96.3  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0535  hypothetical protein  28.68 
 
 
402 aa  93.6  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.492189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  35.02 
 
 
898 aa  94  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.94 
 
 
1433 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  24.86 
 
 
4798 aa  83.2  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3188  hypothetical protein  28.62 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.411764  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  29.71 
 
 
1215 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  30.13 
 
 
1215 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  30.13 
 
 
1215 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.51 
 
 
994 aa  77.8  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.71 
 
 
1215 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  29.71 
 
 
1215 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.81 
 
 
2507 aa  76.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  29 
 
 
4978 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.16 
 
 
850 aa  76.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.36 
 
 
369 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  30.77 
 
 
892 aa  73.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  30.58 
 
 
1416 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  29.47 
 
 
1512 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  31.43 
 
 
5745 aa  67.8  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.09 
 
 
761 aa  67.8  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  32.01 
 
 
2816 aa  67  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  28.41 
 
 
721 aa  64.7  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  28.81 
 
 
2767 aa  63.9  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  29.86 
 
 
8321 aa  60.8  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  27.85 
 
 
1706 aa  60.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  29.1 
 
 
5020 aa  60.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.7 
 
 
2114 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.49 
 
 
1066 aa  59.3  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.97 
 
 
3363 aa  58.9  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  27.12 
 
 
2839 aa  58.2  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.16 
 
 
3816 aa  57.4  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  31.37 
 
 
1269 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  26.78 
 
 
2784 aa  55.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  32.02 
 
 
1269 aa  55.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  29.53 
 
 
1779 aa  54.7  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  26.32 
 
 
2153 aa  54.7  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  28.62 
 
 
7284 aa  54.3  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  25.31 
 
 
2074 aa  53.9  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  25.98 
 
 
4848 aa  53.5  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  30.74 
 
 
2555 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  30.8 
 
 
2454 aa  53.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2591  hypothetical protein  27.78 
 
 
1188 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225113  normal  0.278205 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  26.47 
 
 
1367 aa  51.6  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3803  hypothetical protein  28.45 
 
 
1181 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  30.18 
 
 
1712 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  32.35 
 
 
585 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  30.55 
 
 
1268 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  33.87 
 
 
1428 aa  50.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  24.27 
 
 
3191 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.69 
 
 
1553 aa  49.3  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  40.62 
 
 
2542 aa  48.1  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0780  hypothetical protein  29.17 
 
 
909 aa  47.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.17 
 
 
2812 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1348  PA14 domain protein  37.18 
 
 
581 aa  47  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.37 
 
 
1109 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  27.71 
 
 
3229 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  35.45 
 
 
1141 aa  45.8  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  36.97 
 
 
1750 aa  45.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  29.66 
 
 
1006 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  29.55 
 
 
3089 aa  45.4  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  29.41 
 
 
1806 aa  45.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  28.41 
 
 
1911 aa  45.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  39.47 
 
 
4231 aa  44.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  28.94 
 
 
2084 aa  44.7  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 
885 aa  44.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  28.73 
 
 
1350 aa  44.3  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  36.9 
 
 
715 aa  44.3  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  28.21 
 
 
2890 aa  44.3  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0718  hypothetical protein  25 
 
 
387 aa  44.3  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  26.9 
 
 
1363 aa  44.3  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  23.65 
 
 
3182 aa  44.3  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  34.23 
 
 
6678 aa  44.3  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  29.45 
 
 
653 aa  44.3  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>