More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0980 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0980  thymidylate kinase / thymidylate synthase  100 
 
 		 213 aa  432  1e-120  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.653916  normal  0.0681105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2162  thymidylate kinase  66.51 
 
 		 213 aa  299  3e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.452008  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2643  dTMP kinase  45.15 
 
 		 227 aa  188  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2566  dTMP kinase  46.38 
 
 		 228 aa  187  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2567  thymidylate kinase  39.71 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0661134  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2642  thymidylate kinase  38.76 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  34.12 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  34.62 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  33.17 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  33.02 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2513  Thymidylate kinase-like protein  35.66 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2161  thymidylate kinase related protein  28.43 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  31.44 
 
 		 189 aa  88.2  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  31.12 
 
 		 193 aa  85.5  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  32.23 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  29.86 
 
 		 730 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  29.22 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  31.96 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0979  thymidylate kinase-like protein  26.07 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.382575  normal  0.0661635 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  31.54 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  30.66 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  33.33 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  32.64 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2353  thymidylate kinase  31.03 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  31.51 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  31.51 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  28.86 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  28.91 
 
 		 901 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  30.95 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  27.5 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  27.4 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  29.03 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  28.57 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  30.5 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  30.39 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  31.11 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  27.8 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  29.45 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  27.52 
 
 		 707 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  27.54 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  32.52 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  30.09 
 
 		 707 aa  68.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  29.49 
 
 		 688 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  33.1 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  29.58 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  34.88 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  26.05 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  32.39 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  30.86 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  28.7 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  31.19 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  31.94 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0020  thymidylate kinase  25.34 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  31.91 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  28.72 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  26.85 
 
 		 671 aa  65.1  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  30.88 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  27.88 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  30.87 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  28.24 
 
 		 705 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  28.37 
 
 		 686 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  27.78 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  28.7 
 
 		 703 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  27.91 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  30.59 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0725  dTMP kinase  29.9 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  30.82 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  28.5 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  28.29 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  24.65 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1571  thymidylate kinase  31.03 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  29.3 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  28.29 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2080  dTMP kinase  29.03 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174265  normal  0.0165952 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  25.58 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  33.01 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1411  thymidylate kinase  26.98 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0670165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  30.87 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  26.81 
 
 		 709 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  27.96 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  29.63 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  26.67 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  31.47 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  31.45 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  31.96 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  27.83 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  24.66 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  29.93 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  27.44 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1250  dTMP kinase  30.41 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  28.4 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  27.95 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  26.73 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1281  thymidylate kinase  30.41 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  31.25 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0547  thymidylate kinase  31.01 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  25.69 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  30.77 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  25.35 
 
 		 688 aa  58.5  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  29.65 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>