126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0134 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  84.51 
 
 		 537 aa  957    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0134  DEAD_2 domain-containing protein  100 
 
 		 537 aa  1095    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117441 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  31.36 
 
 		 550 aa  207  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  30.28 
 
 		 541 aa  207  4e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  25.13 
 
 		 582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  25.18 
 
 		 574 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  25.17 
 
 		 634 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  25.17 
 
 		 575 aa  110  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  27.14 
 
 		 588 aa  106  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  24 
 
 		 580 aa  100  8e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  22.31 
 
 		 938 aa  84.7  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  20.62 
 
 		 779 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  27.85 
 
 		 614 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  22 
 
 		 785 aa  66.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  21.14 
 
 		 773 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  30.34 
 
 		 835 aa  63.5  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  22.54 
 
 		 777 aa  63.5  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  22.33 
 
 		 781 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  22.01 
 
 		 773 aa  63.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  23.41 
 
 		 781 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  29.27 
 
 		 849 aa  62.4  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  20.7 
 
 		 750 aa  62  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  23.62 
 
 		 753 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  22.16 
 
 		 774 aa  61.6  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  21.75 
 
 		 791 aa  60.1  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  20.71 
 
 		 801 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  20.88 
 
 		 766 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  20.88 
 
 		 766 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  25.88 
 
 		 849 aa  59.3  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  21.6 
 
 		 761 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  21.49 
 
 		 766 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  22.26 
 
 		 758 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  22.89 
 
 		 772 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  21.68 
 
 		 790 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.37 
 
 		 676 aa  56.6  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  21.03 
 
 		 753 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  20.27 
 
 		 766 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  21.28 
 
 		 773 aa  54.3  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  20.8 
 
 		 775 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  21.35 
 
 		 798 aa  53.9  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  25.39 
 
 		 841 aa  53.5  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  25.75 
 
 		 644 aa  53.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  22.32 
 
 		 726 aa  52.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  21.8 
 
 		 758 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  21.81 
 
 		 755 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  30.08 
 
 		 646 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  21.6 
 
 		 746 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  20.71 
 
 		 766 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  21.6 
 
 		 755 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  21.95 
 
 		 646 aa  52  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  30.08 
 
 		 644 aa  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  24.72 
 
 		 619 aa  52  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  20.07 
 
 		 640 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  20.71 
 
 		 766 aa  51.6  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  24.02 
 
 		 639 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  21.4 
 
 		 798 aa  51.6  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  20.17 
 
 		 669 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  24.35 
 
 		 791 aa  50.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  23.95 
 
 		 645 aa  50.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  20.24 
 
 		 757 aa  50.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  23.42 
 
 		 649 aa  50.8  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  20.9 
 
 		 785 aa  50.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  27.91 
 
 		 651 aa  50.8  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  20.07 
 
 		 640 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  25.15 
 
 		 639 aa  50.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  22.2 
 
 		 807 aa  50.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  26.62 
 
 		 669 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  20 
 
 		 669 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  24.54 
 
 		 649 aa  50.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  20 
 
 		 664 aa  50.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  27.27 
 
 		 773 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  22.07 
 
 		 654 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  21.5 
 
 		 629 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  23.49 
 
 		 641 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  23.44 
 
 		 749 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  21.64 
 
 		 798 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  25.15 
 
 		 641 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  25.95 
 
 		 647 aa  48.9  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  19.9 
 
 		 766 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  23.12 
 
 		 634 aa  48.5  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  20.55 
 
 		 762 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  19.8 
 
 		 639 aa  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  28.96 
 
 		 617 aa  48.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  24.68 
 
 		 634 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  24.68 
 
 		 634 aa  48.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  24.68 
 
 		 634 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  19.52 
 
 		 756 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  21.72 
 
 		 754 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  22.5 
 
 		 636 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  22.5 
 
 		 636 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  22.5 
 
 		 636 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  22.5 
 
 		 636 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  21.56 
 
 		 793 aa  47.8  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  22.5 
 
 		 636 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  22.5 
 
 		 636 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  22.5 
 
 		 636 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  22.5 
 
 		 636 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  22.5 
 
 		 636 aa  47.8  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  21.31 
 
 		 670 aa  47.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  26.61 
 
 		 722 aa  47.8  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>