150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1966 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  100 
 
 		 353 aa  716    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  35.24 
 
 		 351 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  31.06 
 
 		 349 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  29.35 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  26.39 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  29.91 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  30.25 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  30.13 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  28.74 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  30.22 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  27.03 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  24.03 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  22.79 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  26.83 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  24.45 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1375  phage integrase family protein  25.07 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  22.22 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  27.66 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  29.94 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  28.21 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  25.46 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  24.43 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  26.3 
 
 		 333 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  28.95 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  21.94 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  25 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1741  Phage integrase  25 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  25.98 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  25.29 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  29.26 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  24.2 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  22.19 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  29.95 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  27.08 
 
 		 346 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  28.96 
 
 		 296 aa  53.9  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  23.65 
 
 		 379 aa  53.9  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  24.04 
 
 		 326 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  22.9 
 
 		 379 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1378  integrase family protein  20.88 
 
 		 416 aa  53.1  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.545263  hitchhiker  0.00000000645491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  26.4 
 
 		 359 aa  52.8  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3728  phage integrase family protein  25.49 
 
 		 342 aa  52.8  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315534  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  25 
 
 		 370 aa  52.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  26.5 
 
 		 476 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2418  phage integrase family protein  23.85 
 
 		 230 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  25.09 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  23.83 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1931  hypothetical protein  23.19 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00772625  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.03 
 
 		 308 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6159  integrase family protein  23.55 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0495192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  26.83 
 
 		 391 aa  50.4  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  26.11 
 
 		 451 aa  50.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  23.7 
 
 		 341 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  23.72 
 
 		 338 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  26.95 
 
 		 296 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1249  integrase family protein  21.25 
 
 		 388 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.447999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  29.06 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  26.37 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  26.91 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1428  phage integrase family site specific recombinase  31.78 
 
 		 125 aa  48.9  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3046  integrase family protein  29.82 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.78 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.48 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.11 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1692  phage integrase  25.08 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  28.24 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  28.24 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1623  integrase or site-specific recombinase  26.41 
 
 		 466 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  27.04 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  26.35 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  21.2 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  26.75 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1474  phage integrase family site specific recombinase  30.56 
 
 		 164 aa  47.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  25.69 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  27.4 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  25 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  23.32 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  35.06 
 
 		 395 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  24.07 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3025  integrase family protein  26.02 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.13 
 
 		 299 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  27.85 
 
 		 285 aa  47  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  26.92 
 
 		 275 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  24.8 
 
 		 399 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.13 
 
 		 299 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.13 
 
 		 299 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.13 
 
 		 299 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  22.55 
 
 		 367 aa  46.6  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  26.62 
 
 		 387 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  26.94 
 
 		 347 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.13 
 
 		 299 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.13 
 
 		 299 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  22.02 
 
 		 468 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  26.06 
 
 		 342 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  22.27 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  23.78 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.08 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  23.5 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  24.28 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  22.56 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>