42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6159 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6159  integrase family protein  100 
 
 		 387 aa  805    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0495192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2981  integrase family protein  26.1 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2709  integrase family protein  26.87 
 
 		 210 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000251547  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  25.58 
 
 		 302 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  23.55 
 
 		 353 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0342  integrase family protein  26.37 
 
 		 229 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  23.85 
 
 		 337 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  26.4 
 
 		 290 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.34 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  24.37 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  23.91 
 
 		 283 aa  47  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  25.75 
 
 		 258 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  23.91 
 
 		 283 aa  47  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  23.19 
 
 		 336 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  23.7 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  29.57 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1340  phage integrase family protein  23.62 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3700  phage integrase family protein  26.35 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  25.82 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0900  integrase  25 
 
 		 322 aa  45.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000819417  hitchhiker  0.000000626468 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.61 
 
 		 324 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0672  integrase family protein  18.84 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  0.194425 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2006  integrase family protein  28.95 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.162448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  21.96 
 
 		 338 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  25.87 
 
 		 365 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  24.8 
 
 		 274 aa  44.3  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1434  phage integrase family protein  25 
 
 		 322 aa  44.3  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  25.11 
 
 		 333 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  26.43 
 
 		 318 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  24.35 
 
 		 327 aa  43.9  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  21.57 
 
 		 350 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  25.47 
 
 		 365 aa  43.9  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  21.57 
 
 		 343 aa  43.9  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00815  integrase for prophage  21.96 
 
 		 314 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0720843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  22.68 
 
 		 295 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  27.24 
 
 		 295 aa  43.5  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3835  tyrosine recombinase XerC  26.34 
 
 		 304 aa  43.5  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.955587  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3710  phage integrase family protein  24 
 
 		 305 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  25.68 
 
 		 321 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  22.71 
 
 		 306 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1439  integrase family protein  23.47 
 
 		 317 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  24.64 
 
 		 318 aa  42.7  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>