76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2006 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_2006  integrase family protein  100 
 
 		 356 aa  729    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.162448 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0600  integrase family protein  52.11 
 
 		 382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1659  integrase family protein  46.33 
 
 		 366 aa  285  7e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0421076 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1115  integrase family protein  42.77 
 
 		 365 aa  250  2e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1675  integrase family protein  39.24 
 
 		 363 aa  223  4e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  24.12 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  24.53 
 
 		 477 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  23.83 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  27.24 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  27.14 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  23.59 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  26.62 
 
 		 452 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.02 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  29.81 
 
 		 348 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4128  integrase family protein  23.68 
 
 		 400 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  21.25 
 
 		 367 aa  53.1  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  30.6 
 
 		 375 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  31.13 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  25.98 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.36 
 
 		 377 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  22.73 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  23.81 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  25.1 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  22.67 
 
 		 385 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  31.52 
 
 		 471 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  31.52 
 
 		 471 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  23.83 
 
 		 388 aa  50.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  23.66 
 
 		 424 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  21.62 
 
 		 451 aa  49.7  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  20.69 
 
 		 398 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  27.39 
 
 		 273 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  22.97 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.6 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  21.68 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  21.68 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  26.52 
 
 		 273 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2011  integrase family protein  24.68 
 
 		 442 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  24.68 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  27.7 
 
 		 421 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2981  integrase family protein  30.6 
 
 		 307 aa  46.6  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  22.54 
 
 		 381 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  27.78 
 
 		 404 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  26.24 
 
 		 406 aa  46.6  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  25 
 
 		 255 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  21.33 
 
 		 260 aa  46.2  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  22.57 
 
 		 291 aa  46.2  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  21.94 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  24.14 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  26.7 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  27.21 
 
 		 412 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  25 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  26.2 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6159  integrase family protein  28.95 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0495192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  22.39 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  21.33 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  21.19 
 
 		 402 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  27.83 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  21.89 
 
 		 373 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  24.44 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  25.7 
 
 		 404 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  23.74 
 
 		 429 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  25.15 
 
 		 417 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  30 
 
 		 435 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  26.29 
 
 		 384 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  26.99 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  25.86 
 
 		 417 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  35.16 
 
 		 414 aa  43.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  22.22 
 
 		 387 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  26.21 
 
 		 294 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  24.62 
 
 		 290 aa  43.1  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  21.23 
 
 		 428 aa  43.1  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  22.18 
 
 		 282 aa  42.7  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  29.61 
 
 		 283 aa  42.7  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  22.43 
 
 		 387 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  28.21 
 
 		 315 aa  42.7  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>