254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1675 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1675  integrase family protein  100 
 
 		 363 aa  740    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1115  integrase family protein  43.45 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1659  integrase family protein  38.39 
 
 		 366 aa  244  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0421076 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0600  integrase family protein  42.56 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2006  integrase family protein  39.24 
 
 		 356 aa  223  4e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.162448 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  29.92 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4128  integrase family protein  26.91 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.52 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  27.16 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  22.55 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  28.02 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  28.91 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  27.24 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  28.45 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  30.48 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  27.62 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  32.35 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  29.26 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  26.57 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  26.85 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  33.8 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  25.88 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  33.8 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  25.9 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  29.95 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  30.23 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  28.22 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  27.64 
 
 		 477 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  23.21 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  30.43 
 
 		 412 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  28.25 
 
 		 410 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  25.47 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  28.71 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  23.27 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  25.47 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  28.99 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  28.46 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1185  integrase family protein  29.08 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.25 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  24.92 
 
 		 322 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  28.71 
 
 		 304 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  28.71 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2981  integrase family protein  24.17 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3924  integrase family protein  25.59 
 
 		 321 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.733894 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  29.41 
 
 		 429 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  23.13 
 
 		 298 aa  53.1  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  22.78 
 
 		 451 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  28.47 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  25.24 
 
 		 403 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  25 
 
 		 298 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0989  integrase family protein  23.63 
 
 		 355 aa  52  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000138199  hitchhiker  0.00000000000000368709 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  21.97 
 
 		 282 aa  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  27.76 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  21.65 
 
 		 310 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  25.11 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  26.05 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  23.35 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0211  site-specific recombinase, phage integrase family  24.28 
 
 		 230 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  24.71 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  24.42 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  25.55 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  26.48 
 
 		 314 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  28.47 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  23.51 
 
 		 451 aa  50.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  26.21 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  28.16 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  26.18 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.71 
 
 		 300 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  22.65 
 
 		 423 aa  50.1  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.25 
 
 		 315 aa  50.4  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  29.24 
 
 		 399 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  23.62 
 
 		 451 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  22.51 
 
 		 391 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  23.43 
 
 		 412 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  28.97 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7113  integrase family protein  29.63 
 
 		 347 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596865 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  26.59 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  29.33 
 
 		 404 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  22.51 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  27.38 
 
 		 391 aa  49.7  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  25.73 
 
 		 298 aa  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  29.41 
 
 		 354 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  29.41 
 
 		 354 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  22.11 
 
 		 402 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  25.2 
 
 		 392 aa  49.7  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.87 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  28.79 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00841  integrase  27.07 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.87 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  27.86 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  22.27 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.23 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.87 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  24.41 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  25.33 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  25.28 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.74 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  26.59 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  24.41 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>