245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0600 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0600  integrase family protein  100 
 
 		 382 aa  781    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2006  integrase family protein  52.11 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.162448 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1659  integrase family protein  46.41 
 
 		 366 aa  305  9.000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0421076 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1115  integrase family protein  46.51 
 
 		 365 aa  279  5e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1675  integrase family protein  42.56 
 
 		 363 aa  241  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4128  integrase family protein  28.25 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  26.91 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3924  integrase family protein  24.44 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.733894 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  31.22 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  31.61 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  26.58 
 
 		 482 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.27 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.91 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  30.95 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  28.11 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.72 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2981  integrase family protein  26.73 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  25.13 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  26.26 
 
 		 310 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  24.1 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  27.47 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  25.12 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  25 
 
 		 322 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  23.53 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.58 
 
 		 298 aa  57  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  28.21 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  24.52 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0540  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.91 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0147694  normal  0.75101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.72 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2850  tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2471  tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  23.79 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  25.49 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  29.67 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  29.26 
 
 		 273 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  26.15 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.88 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  26.15 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.57 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  29.3 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  25.09 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.67 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  28.5 
 
 		 352 aa  55.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  27.32 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  25.11 
 
 		 277 aa  54.7  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  29.12 
 
 		 341 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  26.15 
 
 		 309 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  22.75 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  28.8 
 
 		 295 aa  54.3  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  28.27 
 
 		 273 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  25 
 
 		 310 aa  53.9  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  27.18 
 
 		 332 aa  53.5  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  25.12 
 
 		 270 aa  53.1  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.57 
 
 		 298 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2540  integrase family protein  28.51 
 
 		 350 aa  53.1  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  24.76 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.57 
 
 		 298 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  30.17 
 
 		 305 aa  52.8  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  27.93 
 
 		 300 aa  52.8  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  21.96 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  25.27 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  29.44 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  30.13 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  21.37 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  22.9 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  21.96 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  28.44 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  24.87 
 
 		 297 aa  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0498  phage integrase family protein  30.87 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000218969  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  30.18 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.57 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  20.76 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.23 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  23.6 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  28.37 
 
 		 301 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  24.46 
 
 		 368 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  25.62 
 
 		 297 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  25.35 
 
 		 353 aa  50.4  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 298 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  29.03 
 
 		 335 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  24.75 
 
 		 388 aa  50.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  27 
 
 		 375 aa  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  24.49 
 
 		 298 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  27.51 
 
 		 301 aa  49.7  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  25.76 
 
 		 306 aa  49.7  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  27.8 
 
 		 304 aa  49.7  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25 
 
 		 394 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  23.66 
 
 		 290 aa  49.7  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  21.24 
 
 		 306 aa  49.7  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25 
 
 		 394 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  29.51 
 
 		 333 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  26.13 
 
 		 417 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.6 
 
 		 298 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  27.41 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.8 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  23.14 
 
 		 282 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>