21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4128 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4128  integrase family protein  100 
 
 		 400 aa  819    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0600  integrase family protein  28.25 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1659  integrase family protein  24.44 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0421076 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1675  integrase family protein  26.91 
 
 		 363 aa  72  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  26.51 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1115  integrase family protein  23.68 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  25.91 
 
 		 304 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2006  integrase family protein  23.68 
 
 		 356 aa  53.5  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.162448 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  23.38 
 
 		 398 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  24.44 
 
 		 353 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  24.57 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  22 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1934  hypothetical protein  39.34 
 
 		 67 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  21.4 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  24.31 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2770  integrase family protein  29.76 
 
 		 434 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00484712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  24.19 
 
 		 273 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  22.31 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  27.05 
 
 		 342 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  24.26 
 
 		 304 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  23.26 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>